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國自然研究熱點“常青樹”| 外泌體介紹Ⅰ

閱讀:870      發(fā)布時間:2023-12-20
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背景介紹:

 

剛發(fā)現(xiàn)外泌體時,這種比多泡體還要小的細胞外囊泡被視為細胞外排出的代謝垃圾,但隨著對這種細胞外囊泡不斷地深入研究,發(fā)現(xiàn)這種細胞外囊泡在細胞之間的通訊交流中發(fā)揮著極其重要的作用。

 

外泌體是什么?

 

外泌體是機體所有活細胞分泌的一種直徑約為30-150nm的細胞外囊泡,廣泛存在于各種生物體液(血液、尿液、母乳、唾液、胸水、腹水、腦脊液等)中。它們由蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、核酸的特定成分組成,可以將信號傳遞給受體細胞,從而介導(dǎo)細胞間的通訊。外泌體在多種生物學(xué)功能中發(fā)揮著重要作用,包括參與RNA、蛋白質(zhì)、酶和脂質(zhì)等生物分子的轉(zhuǎn)移,以及各種生理和病理過程的調(diào)節(jié)。

 

外泌體屬于細胞外囊泡的一種,根據(jù)直徑大小以及釋放機制的不同可將細胞外囊泡主要分為外泌體、微囊泡、凋亡小體,它們都參與細胞間信息傳遞,但目前對于外泌體的研究最多。

 

表 外泌體與其他細胞外囊泡的區(qū)別


分類

外泌體

微囊泡

凋亡小體

直徑

30-150nm

100-1000nm

500-4000nm

密度

1.1-1.18g/mL

1.02-1.22g/mL

1.16-1.28g/mL

來源

細胞內(nèi)的多泡小體與細胞膜融合后,其內(nèi)的小泡釋放到細胞外

細胞膜出芽形成

凋亡時細胞膜皺縮內(nèi)陷,分割包裹胞質(zhì)形成的泡狀小體

內(nèi)含物

mRNA、miRNA、非編碼RNA、蛋白(細胞質(zhì)、膜)、MHC

mRNA、miRNA、非編碼RNA、蛋白

核組分、DNA、細胞器

蛋白標志物

Alix、TSG101、HSC70、CD63、CD81、CD9

Selectin、integrins、CD40、MMP

Histones

功能

細胞內(nèi)通訊、細胞間物質(zhì)交流

細胞內(nèi)通訊、在細胞間運輸遺傳物質(zhì)

調(diào)節(jié)病理和生理過程




 

圖 外泌體與其他細胞外囊泡

 

外泌體的結(jié)構(gòu)組成:

 

外泌體具有脂質(zhì)雙分子層結(jié)構(gòu),由膽固醇、鞘磷脂和磷酸甘油酯等成分共同組成,在其脂質(zhì)雙分子層的表面附著有粘附分子、主要組織相容性復(fù)合體(major histocompatibility complex,MHC)、大量的特定蛋白質(zhì),包括四跨膜蛋白、熱休克蛋白等等和各種特定的配體(CD9、CD63、CD81等)。在外泌體的內(nèi)腔中還攜帶各種生物活性物質(zhì),包括核酸、某些酶類、蛋白分子、細胞代謝物等,核酸例如信使核糖核酸(messenger ribonucleic acid,mRNA)、微小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)、脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)和長鏈非編碼核糖核酸(Longnon-coding ribonucleic acid,LncRNA)等。


圖 外泌體的結(jié)構(gòu)組成

 

外泌體的功能:

 

外泌體的功能起決于其所來源的細胞類型。外泌體能夠?qū)⒑怂?、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)在內(nèi)的多種生物活性分子從供體細胞轉(zhuǎn)移到受體細胞,介導(dǎo)細胞間通訊和分子轉(zhuǎn)運;并且外泌體可以由所有類型的活細胞分泌,在體液中廣泛分布。它可參與機體免疫應(yīng)答、抗原提呈、細胞遷移、細胞分化、細胞遷移、腫瘤侵襲等方面,因此外泌體在生理病理標志物和藥物遞送方面有巨大的應(yīng)用潛力。

 

外泌體提?。?/strong>

 

進行外泌體研究,首先要將其從樣本中提取出來。目前已有許多基于外泌體物理及生化特性的分離方法,傳統(tǒng)方法包括超速離心、密度梯度離心、超濾、尺寸排阻色譜(size-exclusionchromatography,SEC)、聚合物沉淀法、免疫親和層析,還有一些新的微流體技術(shù)、商業(yè)試劑盒。


圖 外泌體分離純化方法合集

 

超速離心:

 

超速離心法是常用也是分離外泌體的“金標準"方法。其原理是利用溶液顆粒大小和密度導(dǎo)致沉降速率不同,來分離不同組分。該方法包含以下步驟:低速離心去除細胞和凋亡碎片;其次以更高離心力消除更大囊泡;最后高速離心沉淀外泌體。該方法操作簡便,可以擴展為大規(guī)模外泌體制備。在過去30年中,超速離心法被廣泛應(yīng)用于從細胞培養(yǎng)基、血清、體液中分離外泌體。但是該方法特異性不強、可混有分子量相近的蛋白質(zhì),同時高速離心力可能破壞外泌體膜泡影響下游分析。


圖 超速離心法分離外泌體

 

密度梯度離心:

 

密度梯度離心利用顆粒大小與密度差異對外泌體進行分離。密度梯度離心會預(yù)先使用蔗糖或碘克沙醇制作密度梯度。樣品從頂部加入離心管,在離心過程中逐漸自上而下沉降,在一定密度區(qū)間聚集。外泌體通常密度范圍為1.1~1.2g/mL。該方法的局限性是分離樣本容量受到密度區(qū)帶寬度的限制,因此密度梯度離心不便于處理大樣本。


圖 密度梯度離心分離外泌體

 

超濾:

 

超濾是基于外泌體尺寸進行分離的方法。根據(jù)膜孔的尺寸和截留分子量,將小顆粒通過膜孔進入濾液,大顆粒截留在膜表面。超濾的主要缺點為液體流動方向平行膜孔方向,造成大顆粒堵塞膜孔,同時產(chǎn)生的剪切力也會使外泌體變形或裂解。


圖 超濾法純化外泌體

 

尺寸排阻色譜(SEC):

 

SEC原理為根據(jù)顆粒尺寸進行分離。在色譜柱中填充多孔固定相,小顆??梢源┻^固定相中的空隙,因此沉降路徑變長,較大顆粒更晚沉降,因此可以分離尺寸差別較大的顆粒。通常SEC會*行超速離心預(yù)處理以此減少雜質(zhì)、提高純度。SEC最大的優(yōu)勢是可以很好的保留外泌體活性。


圖 尺寸排阻色譜(SEC)純化外泌體

 

聚合物沉淀法:

 

聚合物沉淀原理是利用超親水聚合物,如PEG結(jié)合溶液中水分子使溶質(zhì)溶解度降低進而沉淀析出,最后通過低速離心獲得外泌體可以廣泛用于各種樣品類型,如血液、培養(yǎng)基、尿液、腦脊液等。其優(yōu)點是可處理大樣本,產(chǎn)量較高。缺點是分離的外泌體會受到其他蛋白質(zhì)污染。


圖 聚合物沉淀法純化外泌體

 

免疫親和層析:

 

免疫親和層析基本原理通過配體與抗體特異結(jié)合進而分離純化。一般用外泌體表面生物標記物作為配體,如四跨膜蛋白超家族、囊泡轉(zhuǎn)運分類內(nèi)涵體復(fù)合物、復(fù)合物相關(guān)蛋白??贵w吸附在磁珠、多孔二氧化硅單片板、膜親和過濾器上,溶液通過時可特異結(jié)合外泌體表面蛋白進行分離純化。常見方法有基于微孔板的酶聯(lián)免疫吸附測定與磁珠免疫捕獲。此類方法具有高特異性,并可以保證外泌體生物活性。


圖 磁珠法免疫捕獲外泌體

 

外泌體提取操作步驟:

 

以磁珠捕獲法提取外泌體、尿液樣本為例(abs9775):

 

組分:

名稱

規(guī)格

儲存

EVtrap magnetic

1mL

2-8℃

Incubation buffer I

5mL

常溫

Incubation buffer II

50mL

常溫

Washing Buffer

50mL

2-8℃

Elution Buffer

20mL

常溫

 







1、樣品前處理

 

取晨尿(中段尿),2500g離心10min以去除細胞碎片,收集上清,重復(fù)1次,將處理好的尿液放置在-80℃儲存?zhèn)溆谩?/span>

 

2、外泌體分離純化

 

1)向10mL的尿液中加入1mL Incubation Solution I上下混勻(若尿液儲存在-80℃,可以在37℃的水浴中解凍后使用);

2)加入200μL EVtrap magnetic 室溫下孵育0.5-1h,磁吸去上清;

3)加入10mL Incubation Solution Ⅱ上下顛倒混勻20-30次,磁吸去上清;

4)加入5mL Washing Buffer上下顛倒混勻20-30次,磁吸去上清,洗1次;

5)加入1mL Washing Buffer上下顛倒混勻20-30次,轉(zhuǎn)移至1.5mL離心管,磁吸去上清;

6)加入200μL的Elution Buffer,渦旋10min;

7)磁吸收集洗脫液,重復(fù)步驟6,將兩次洗脫液共400μL合并到一個離心管中,渦旋混勻后再瞬離;

8)凍干洗脫液,將凍干后樣品置于-80℃長期保存,或用于下游檢測實驗。

 

實驗注意事項:

 

1)將EVtrap magnetic儲存在4℃,孵育液和洗滌液等儲存在室溫;
2)磁吸時請使用高磁磁力架,以保證磁珠的外泌體捕獲效果;
3)在任何洗滌步驟中不要劇烈渦旋。將樣品上下顛倒20-30次使磁吸后的磁珠結(jié)團分散即可;
4)孵育后的操作步驟中,在進行上下顛倒混勻時,動作要輕柔,以避免與EVtrap magnetic捕獲的外泌體脫落。

 

實驗結(jié)果:



圖 使用此外泌體提取試劑盒提取外泌體進行WB檢測結(jié)果

 

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分類

貨號

產(chǎn)品名稱

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abs9775

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1mL

abs9777

外泌體純化試劑盒(SEC)

1mL

abs50039

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20T

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20T




 

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20mL

外泌體定量

abs50054

外泌體定量檢測試劑盒

96T




 


參考文獻


[1] Kalluri R, LeBleu VS. The biology, function, and biomedical applications of exosomes. Science. 2020 Feb 7;367(6478):eaau6977. doi: 10.1126/science.aau6977. PMID: 32029601; PMCID: PMC7717626.

[2] Pegtel DM, Gould SJ. Exosomes. Annu Rev Biochem. 2019 Jun 20;88:487-514. doi: 10.1146/annurev-biochem-013118-111902. PMID: 31220978.

[3] Zhang L, Yu D. Exosomes in cancer development, metastasis, and immunity. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2019 Apr;1871(2):455-468. doi: 10.1016/j.bbcan.2019.04.004. Epub 2019 Apr 30. PMID: 31047959; PMCID: PMC6542596.

[4] Kalluri R. The biology and function of exosomes in cancer. J Clin Invest. 2016 Apr 1;126(4):1208-15. doi: 10.1172/JCI81135. Epub 2016 Apr 1. PMID: 27035812; PMCID: PMC4811149.

[5] Gurunathan S, Kang MH, Jeyaraj M, Qasim M, Kim JH. Correction: Gurunathan, S. et al. Review of the Isolation, Characterization, Biological Function, and Multifarious Therapeutic Approaches of Exosomes. Cells 2019, 8, 307. Cells. 2021 Feb 22;10(2):462. doi: 10.3390/cells10020462. Erratum for: Cells. 2019 Apr 03;8(4): PMID: 33671844; PMCID: PMC7926903.

 

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