Q1:我該如何得到很好的多色結(jié)果呢?
A1:首先,您需要有質(zhì)量不錯的樣本和抗體,這就已經(jīng)是成功的一半(樣本、抗體選擇攻略),對于樣本來說,脫片是我們需要預防的“頭號公敵",多色實驗需要重復熱修復洗脫抗體多次,假如片子脫片,輕則成像模糊,重則組織脫落前功盡棄,可以在開始實驗之前先模擬幾輪熱修復,不加抗體和其他試劑,看看組織是否有脫落的跡象,如果脫落比較嚴重,則需要重新制備切片,如果有輕微脫片,則可以考慮購買抗體洗脫液(abs994),替代熱修復的過程;然后,就可以開始做實驗了,我們建議您*行抗體和染料工作條件摸索,再上多染(參考下圖流程),這樣多染的成功率可以達到90%以上哦!(小愛經(jīng)驗之談,即便是染了千百遍的常見指標,換個樣本,染色效果就可能天差地別,有條件還是建議要做預實驗。)
最后的10%,就需要調(diào)整指標與染料搭配以及染色的順序了。
Q2:有沒有推薦的染料搭配和染色順序呢?
A2:染料搭配一般遵循“寡靶配強光,眾靶配弱光"的原則,意思是表達比較弱的指標搭配熒光信號比較強的染料,表達相對強的指標搭配信號比較弱的染料,Absin的TSA染料波長越短熒光強度越強,比如說需要染PD-1,CD8和CD3,我們手里有一個四色試劑盒(TSA520/TSA570/TSA650),通過IHC發(fā)現(xiàn)樣本中PD-1的信號很少,CD3信號非常多,其次是CD8,于是選擇TSA520搭配PD-1,TSA650搭配CD3,TSA570搭配CD8,比較合理。
接下來就是怎么安排染色先后順序:
1)劃分細胞定位,先外后內(nèi):確定每個指標的細胞定位,膜表達先染,胞漿或者胞核的后染(如果是指標比較多的情況下,胞內(nèi)指標排在比較后面,經(jīng)過前期多輪洗脫,可以不做細胞通透;如果指標很少,染胞內(nèi)指標之前還是需要打孔,多個胞內(nèi)指標也只需要打一次孔);
2)確定抗原修復方式,先酸后堿:堿修復比酸修復的力度會更強,個別抗體在用堿修復以后會染出來很多非特異性,所以如果是相同的細胞定位,就先染酸修復,再染堿修復的抗體;
3)根據(jù)IHC結(jié)果判別,先弱后強:組化結(jié)果顯示指標比較少,比較弱的,排在前面染,理論上來說越靠前染的指標效果會越接近單標染色。
以上就是一些通用規(guī)則,但不同的指標還是可能出現(xiàn)變化,要想得到較好的結(jié)果,就需要不同的排列組合一個一個嘗試(如下表,“X"代表有信號),這樣會比較耗費時間和試劑,您可以根據(jù)通用規(guī)則先行一次多染,然后各通道跟熒光單染做對比,如果效果差別很大,那就再調(diào)整染色順序,如果單染的結(jié)果跟組化差別比較大(出現(xiàn)高背景,非特異性明顯),就要考慮更換染料搭配。
Target | Best Signal | Recommended | ||
1st AR | 3rd AR | 6th AR | ||
FOXP3 |
|
| x | 1:250 |
PD-1 | x |
|
| 1:250 |
LAG3 |
| x | x | 1:250 |
CD4 |
| x | x | 1:250 |
Q3:我成像完了以后想要做數(shù)據(jù)分析,你們有什么軟件推薦嗎?
A3:目前市面上數(shù)據(jù)分析軟件還是比較多的,像免費的您可以下載imageJ、Qupath,缺點就是用法都需要您自行摸索;我們公司安裝的是HALO和StrataQuest兩款軟件,HALO是付費的,StrataQuest是我們TG的掃描儀平臺自帶的,從功能、分析的精準度和可操作性來說,肯定是大大優(yōu)于開源軟件的,且有軟件專業(yè)的技術(shù)支持團隊能夠答疑解惑。您可以根據(jù)您的實際情況選擇合適的分析軟件,如果您實在無從下手,也可以找Absin,我們可以提供數(shù)據(jù)分析的服務~
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貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 貨期 |
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abs50013 | 五色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗) | 20T/100T | 現(xiàn)貨 |
abs50029 | 五色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗) | 20T/100T | 現(xiàn)貨 |
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abs50030 | 六色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗) | 20T/100T | 現(xiàn)貨 |
abs50015 | 七色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗) | 20T/100T | 現(xiàn)貨 |
abs50031 | 七色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗) | 20T/100T | 現(xiàn)貨 |
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CD相關(guān)抗體 | CD3、CD8a、CD4、CD68、CD206、CD163、CD20、CD19、CD45、CD56、CD10、CD117、CD138、CD14、CD146、CD15、CD1a、CD2、CD21、CD23、CD25、CD30、CD31、CD34、CD35、CD38、CD3G、CD44、CD5、CD7、CD79a、CD79B、CD99 |
角蛋白(CK)相關(guān)抗體 | panCK、CK-4、CK HMW、CK-1、CK-10、CK-14、CK-17、CK-18、CK-19、CK-20、CK-5、CK-5&6、CK-6、CK-7、CK-8、CK-8&18 |
癌癥腫瘤相關(guān) | p120、p16、p21、p40、p53、p63、AFP、ALK、AMACR、ANXA1、Aurora-B、Bcl-6、CTNNB1、CA125、CDK4、CDX2、CEA、CCND1、c-MET、c-Myc、DOG1、CDH1、EGFR、EpCAM、ERG、EZH2、FABP3、FGFR2、FOXP1、GATA-3、GCDFP-15、GPC3、GZMB、HER-2、IDH1 R132H、Ki-67、LDLR、MCM7、MCM3、MGMT、MSH2、MSH6、MUC1、MUC2、MUC4、MUM1、MyoD1、Myogenin、Myosin (Smooth Muscle)、Napsin-A、N-Cadherin、Olig2、PAX-2、PAX-5、PAX-8、PCT、PD-1、PHH3、PLAP、PMEL-17、PDPN、PR、PSA、PSAP、S100A1、S100P、SALL4、SATB1、SF-1、SOX10、SOX11、SOX2、STAT6、Stathmin、TCL1、TFE3、TG、TLE1、TOP2A、TPO、TRPS1、TTF-1、Type I Cytokeratins、Type II Cytokeratins、Uroplakin III、Villin、WT1、ZAP-70 |
神經(jīng)相關(guān) | ATRX、p75 NGF Receptor、CgA、DDX4、GFAP、λLight Chains、MBP、NeuN、Neurofilament、NSE、Olig2、p75 NGF Receptor、S100、SYP |
血管 | ACE2、VEGF、VWF |
鈣蛋白 | CALB1、Caldesmon、Calponin、Calcitonin、Calprotectin |
其他 | MPO、AR、Arg-1、AR-V7、B2M、CLDN1、Collagen Type Ⅳ、COL4A5、ERα、GH、HBSAg、hCG、hCG-beta、hPL、IgD、IgG、IgM、IGFBP3、Insulin、Oct3/4、SCGN、Somatostatin、TDT、Actin、Desmin |
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