對(duì)于做過分子實(shí)驗(yàn)的小伙伴來說,傳統(tǒng)的分子克隆技術(shù)——酶切連接,大家應(yīng)該都是比較熟悉的,那么對(duì)于其他的分子克隆技術(shù)類型大家有了解過嗎?根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)需求,來選擇不同的分子克隆技術(shù)以及產(chǎn)品。本期,小愛帶大家一起來了解下幾種常規(guī)的分子克隆技術(shù)吧。
一、酶切連接
酶切連接法屬于經(jīng)典的分子克隆方法,利用限制性內(nèi)切酶切割DNA和利用DNA連接酶連接DNA,最后轉(zhuǎn)化篩選及純化,完成重組基因的大量制備。
圖1 酶切連接流程
成功的酶切和有效的連接是分子克隆實(shí)驗(yàn)圓滿完成的必要條件。限制性內(nèi)切酶能特異性地結(jié)合于能被限制性內(nèi)切酶識(shí)別的DNA序列之內(nèi)或其附近的特異性位點(diǎn)上,并切割雙鏈DNA。根據(jù)限制酶的識(shí)別切割特性、催化條件以及是否有修飾酶活性,可分為Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型。分子克隆技術(shù)中常用的是Ⅱ型酶,切割后得到的是帶粘性末端或平末端的線性DNA。
粘性末端,即限制性內(nèi)切酶在DNA雙鏈上交錯(cuò)切割,形成的核苷酸順序互補(bǔ)的,可形成氫鍵的末端(見圖2)。
平齊末端,限制性內(nèi)切酶在DNA雙鏈的相同位置切割DNA分子,這樣形式的斷裂是形成具有平末端的DNA片斷(見圖3)。
圖2 EcoR I切割DNA形成粘性末端DNA片段
圖3 AluI切割DNA形成平末端DNA片段
Absin擁有目前常用的幾種限制性內(nèi)切酶,包括快速內(nèi)切酶BsaI(abs60206)、快速內(nèi)切酶ClaI(abs60209)、快速內(nèi)切酶EcoRI(abs60213)、快速內(nèi)切酶HindIII(abs60217)等四十多種。
Absin限制性內(nèi)切酶產(chǎn)品特點(diǎn):
1、快速酶切:5-15min即可完成酶切;
2、通用的buffer:大大簡(jiǎn)化了酶切反應(yīng);
3、高保真:極低的星號(hào)活性;
4、高度冗余:輕松應(yīng)對(duì)過量、復(fù)雜底物;
5、良好的兼容:經(jīng)驗(yàn)證所有Absin快速內(nèi)切酶與其他品牌酶切體系相互兼容。
表1 Absin限制性內(nèi)切酶介紹
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs60200 | 快速內(nèi)切酶ApaLI | 200T |
abs60201 | 快速內(nèi)切酶AscI | 50T |
abs60202 | 快速內(nèi)切酶AvrII | 25T |
abs60203 | 快速內(nèi)切酶BamHI | 500T |
abs60204 | 快速內(nèi)切酶BclI | 125T |
abs60205 | 快速內(nèi)切酶BglII | 100T |
abs60206 | 快速內(nèi)切酶BsaI | 50T |
abs60207 | 快速內(nèi)切酶BstBI | 100T |
abs60208 | 快速內(nèi)切酶BstEII | 100T |
abs60209 | 快速內(nèi)切酶ClaI | 50T |
abs60210 | 快速內(nèi)切酶DpnI | 50T |
abs60211 | 快速內(nèi)切酶DpnII | 50T |
abs60212 | 快速內(nèi)切酶EagI | 25T |
abs60213 | 快速內(nèi)切酶EcoRI | 600T |
abs60214 | 快速內(nèi)切酶EcoRV | 200T |
abs60215 | 快速內(nèi)切酶Esp3I(BsmBI) | 30T |
abs60216 | 快速內(nèi)切酶FspI | 50T |
abs60217 | 快速內(nèi)切酶HindIII | 500T |
abs60218 | 快速內(nèi)切酶HinfI | 500T |
abs60219 | 快速內(nèi)切酶HpaI | 50T |
abs60220 | 快速內(nèi)切酶KpnI | 200T |
abs60221 | 快速內(nèi)切酶MluI | 100T |
abs60222 | 快速內(nèi)切酶MnlI | 50T |
abs60223 | 快速內(nèi)切酶NcoI | 30T |
abs60224 | 快速內(nèi)切酶NdeI | 200T |
abs60225 | 快速內(nèi)切酶NheI | 30T |
abs60226 | 快速內(nèi)切酶NotI | 50T |
abs60227 | 快速內(nèi)切酶NruI | 50T |
abs60228 | 快速內(nèi)切酶NsiI | 25T |
abs60229 | 快速內(nèi)切酶PacI | 25T |
abs60230 | 快速內(nèi)切酶PstI | 500T |
abs60231 | 快速內(nèi)切酶PvuII | 200T |
abs60232 | 快速內(nèi)切酶SacI | 100T |
abs60233 | 快速內(nèi)切酶SacII | 50T |
abs60234 | 快速內(nèi)切酶SalI | 200T |
abs60235 | 快速內(nèi)切酶SbfI | 25T |
abs60236 | 快速內(nèi)切酶SmaI | 100T |
abs60237 | 快速內(nèi)切酶SpeI | 50T |
abs60238 | 快速內(nèi)切酶SphI | 50T |
abs60239 | 快速內(nèi)切酶SspI | 60T |
abs60240 | 快速內(nèi)切酶StuI | 100T |
abs60241 | 快速內(nèi)切酶TaqI | 200T |
abs60242 | 快速內(nèi)切酶XbaI | 500T |
abs60243 | 快速內(nèi)切酶XhoI | 500T |
abs60244 | 內(nèi)切酶SgeI | 250U |
核酸片段可以通過連接酶的作用連接起來而獲得重組分子。DNA接酶催化雙鏈DNA子中相鄰堿基的5’-P末端與3-0H間形成3’,5’-磷酸二酯鍵。常用的DNA連接酶是T4 DNA連接酶——T4 DNA Ligase(abs60084),被稱為生物界的“502"。在有Mg2+和ATP存在的條件下,T4 DNA Ligase能催化雙鏈DNA或RNA上相鄰的5′-磷酸末端和3′-羥基末端形成磷酸二酯鍵。該酶不僅能夠催化雙鏈DNA的平末端或粘性末端之間的連接,還可以修復(fù)雙鏈DNA、RNA或DNA/RNA雜交雙鏈中的單鏈切刻,但不能催化單鏈DNA之間的連接。
圖4 T4 DNA連接酶作用位點(diǎn)
二、TA克隆
TA克隆是指把PCR片段與一個(gè)具有3‘-T突出的載體DNA連接起來的方法??捎糜诓磺宄康幕虻腄NA序列,獲得的目的片段通常需要通過TA克隆的方法重組到T-載體中,通過測(cè)序測(cè)定DNA序列。Absin T-Vector快速克隆試劑盒(abs60085)是高效、便利的PCR產(chǎn)物克隆專用試劑盒。
Absin T-Vector快速克隆試劑盒(abs60085)產(chǎn)品特點(diǎn):
1、陽性率高:高純度酶切型線性T載體,連接效率更高,藍(lán)斑率低于10% ;
2、方便快捷:預(yù)混連接反應(yīng)體系,最快5分鐘實(shí)現(xiàn)連接,無需純化,直接轉(zhuǎn)化;
3、T Simple載體無常用酶切位點(diǎn),利于含酶切位點(diǎn)基因克??;
4、無NdeI或NcoI位點(diǎn),便于重組表達(dá)基因的克??;
5、提供純化的PCR片段作為陽性質(zhì)控對(duì)照;
6、藍(lán)白篩選:高表達(dá)活性的β-半乳糖苷酶,顯色更快更深;
7、批次穩(wěn)定:遵循標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)流程,經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量檢測(cè)。
圖5 TA克隆流程
三、無縫克隆
無縫克隆技術(shù)是一種新的、快速、簡(jiǎn)潔的克隆方法,可以在質(zhì)粒的任何位點(diǎn)進(jìn)行一個(gè)或多個(gè)目標(biāo)DNA的片斷的插入,而不需要任何限制性內(nèi)切酶和連接酶,只需要一步重組法,即可得到高效率克隆的重組載體,大大提高了工作效率。Absin快速多片段DNA組裝預(yù)混液(abs60250)就是基于重組原理的無縫克隆技術(shù),它不依賴繁瑣的酶切、連接步驟,也不需要末端補(bǔ)平等操作,依據(jù)DNA片段與線性化載體末端的15~25nt 同源序列的重組,可將插入片段克隆至任意線性載體的任意位點(diǎn),載體自連背景極低,是一種簡(jiǎn)單、快速、高效的DNA定向克隆技術(shù)。
Absin快速多片段DNA組裝預(yù)混液(abs60250)特點(diǎn):
1、簡(jiǎn)單便捷:兼容PCR產(chǎn)物體系與載體酶切體系,省去繁瑣的純化步驟;
2、高陽性率:定向克隆單個(gè)DNA片段至載體上,陽性率高于95%;
3、快速反應(yīng):反應(yīng)時(shí)間大大縮短,最快僅需5min;
4、單/多片段均可連接:?jiǎn)蝹€(gè)或多個(gè)片段同時(shí)插入,省去重復(fù)純化與酶切過程。
圖6 Absin快速多片段DNA組裝預(yù)混液(abs60250)無縫克隆操作流程
四、TOPO克隆
TOPO克隆實(shí)際是基于拓?fù)洚悩?gòu)酶的克隆技術(shù),關(guān)鍵是拓?fù)洚悩?gòu)酶。該技術(shù)不需要限制性內(nèi)切酶或外源連接酶,從而提供了將新的PCR產(chǎn)物克隆到質(zhì)粒中的極其簡(jiǎn)便快捷的方法。
TOPO克隆產(chǎn)品特點(diǎn):快捷,不需連接酶,克隆三步到位。
表2 愛必信TOPO克隆產(chǎn)品
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs60091 | T-Vector pTOPO快速克隆試劑盒 | 20T/100T |
abs60094 | Blunt pTOPO快速克隆試劑盒 | 20T/100T |
abs60095 | pBM16A Toposmart快速克隆試劑盒 | 20T/3×20T |
abs60096 | pBM27 Toposmart快速克隆試劑盒 | 20T/3×20T |
五、Geteway克隆
Geteway克隆利用位點(diǎn)特異重組實(shí)現(xiàn)目的片段的插入的,載體上的一段目的片段在重組酶的作用下會(huì)替換成目的片段,不依賴限制性內(nèi)切酶和連接酶,導(dǎo)入目的基因不需要開環(huán)處理,載體需要用試劑盒提供的載體,一般需要用到兩個(gè)載體,快速、高效將DNA序列轉(zhuǎn)移到載體上的克隆。
Absin特色產(chǎn)品線:
WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、預(yù)制膠;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆;IP/CoIP試劑盒;激動(dòng)劑/抑制劑;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒;重組蛋白;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體、對(duì)照抗體;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...
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