上期給大家介紹了分子克隆的概念、原理以及通用實(shí)驗(yàn)流程,相信大家已經(jīng)對(duì)分子克隆技術(shù)應(yīng)該有一定了解了,詳見(jiàn) “分子克隆技術(shù)全攻略" 。本期小愛(ài)將為大家講解分子克隆的載體——質(zhì)粒。走!瞅瞅去!
分子克隆技術(shù)運(yùn)用的載體只要是指將DNA片段(目的基因)轉(zhuǎn)移至受體細(xì)胞的一種能自我復(fù)制的DNA分子工具。常見(jiàn)的載體主要有質(zhì)粒、噬菌體、病毒等。今天咱們要聊的主角是質(zhì)粒。
一、什么是質(zhì)粒?
天然質(zhì)粒是可獨(dú)立于染色體外可自行復(fù)制的環(huán)狀DNA分子,通常帶有一些基因,特別是一些與抗生素耐藥性有關(guān)的基因,可以在不同的細(xì)菌細(xì)胞之間傳遞。質(zhì)粒主要存在于細(xì)胞、古生菌及真核生物中,比較特殊的在植物的葉綠體和線(xiàn)粒體等胞器中也有出現(xiàn)。
研究報(bào)道指出質(zhì)粒也不全是環(huán)狀的哦!1984年,在Streptomyces coelicoler(天藍(lán)色鏈霉菌)等放線(xiàn)菌以及在Borrelia hermsii(赫氏蜱疏螺旋體)等原核生物中,又相繼發(fā)現(xiàn)線(xiàn)形質(zhì)粒。基于質(zhì)粒能夠攜帶基因,并且能夠在不同細(xì)胞中傳代基因的特性,質(zhì)粒被運(yùn)用到分子克隆技術(shù)中。在分子克隆技術(shù)中運(yùn)用的質(zhì)粒載體是在天然質(zhì)粒的基礎(chǔ)上為適應(yīng)實(shí)驗(yàn)室操作而進(jìn)行人工改造得來(lái),通常所用的是細(xì)菌載體質(zhì)粒。
它在分子克隆技術(shù)中的運(yùn)用是將某種目標(biāo)基因片段重組到質(zhì)粒中,構(gòu)成重組基因或重組體。將這種重組體經(jīng)微生物學(xué)的轉(zhuǎn)化技術(shù),轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞(如大腸桿菌)中,使重組體中的目標(biāo)基因在受體菌中得以繁殖或表達(dá),從而改變寄主細(xì)胞原有的性狀或產(chǎn)生新的物質(zhì)。
細(xì)菌質(zhì)粒是基因工程中常用的載體,這些質(zhì)粒至少要有復(fù)制起點(diǎn)、篩選標(biāo)記和克隆位點(diǎn)?;A(chǔ)的部分我們都來(lái)詳細(xì)了解下。
二、質(zhì)粒結(jié)構(gòu)原件有哪些?
圖1 質(zhì)粒圖譜
1)復(fù)制起始位點(diǎn)(Origin of Replication,ORI)
ORI是一段DNA序列,質(zhì)粒復(fù)制的起始位置。DNA解螺旋酶可以作用于這段序列,然后DNA的雙鏈被分開(kāi),復(fù)制隨即開(kāi)始。質(zhì)粒必須是能夠復(fù)制的,否則隨著細(xì)菌的生長(zhǎng),質(zhì)粒的數(shù)量將會(huì)被迅速稀釋。
2)抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Gene)
抗生素抗性基因存在作用是快速篩選。在含有抗生素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)細(xì)菌,能夠生長(zhǎng)的就是含有目的質(zhì)粒,不含質(zhì)粒的細(xì)菌已經(jīng)被“殺死"了。
3)篩選標(biāo)記(Selectable Marker)
篩選已經(jīng)成功攝取質(zhì)粒的細(xì)胞。該篩選標(biāo)記需要區(qū)別于細(xì)菌中的抗性篩選。細(xì)菌抗性基因篩選用于質(zhì)粒擴(kuò)增過(guò)程,篩選標(biāo)記用于篩選或標(biāo)記轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞。篩選標(biāo)記通常是抗性篩選或者熒光蛋白。
4)啟動(dòng)子(Promoter)
啟動(dòng)子是能夠使基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。啟動(dòng)子可以被RNA聚合酶辨別,并開(kāi)始轉(zhuǎn)錄。啟動(dòng)子常位于目的基因上游100-1000bp位置處,是質(zhì)粒非常重要的一個(gè)元件,它決定著目的基因可以在何種細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá),也決定蛋白質(zhì)的表達(dá)量。
5)多克隆位點(diǎn)(Multiple Cloning Site, MCS)
多克隆位點(diǎn)是一段短DNA片段,包括多個(gè)限制性酶切的單一位點(diǎn),便于外源基因的插入。一般來(lái)說(shuō),外源DNA片段越長(zhǎng),越難插入,越不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化效率越低。在表達(dá)型質(zhì)粒中,MCS常處于啟動(dòng)子的后面。
6)引物結(jié)合位點(diǎn)(Primer Binding Site)
引物結(jié)合位點(diǎn)為一小段DNA片段,用來(lái)進(jìn)行質(zhì)粒的PCR擴(kuò)增或者測(cè)序。
7)插入片段(Inserted Gene)
插入片段又稱(chēng)為外源性基因,是克隆到MCS中的基因、啟動(dòng)子或其他DNA片段,通常是人們所希望研究的遺傳元件。
三、質(zhì)粒的分類(lèi)有哪些?
1)表達(dá)質(zhì)粒:用于基因表達(dá)(基因功能的研究)。表達(dá)載體必須包含啟動(dòng)子、轉(zhuǎn)錄終止子序列和插入基因。啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)插入DNA轉(zhuǎn)錄生成RNA,合成的RNA上的終止子序列發(fā)出停止轉(zhuǎn)錄過(guò)程的信號(hào)。表達(dá)載體可以通過(guò)增強(qiáng)子序列增加蛋白質(zhì)或RNA的產(chǎn)量。表達(dá)載體可以在各種細(xì)胞類(lèi)型(哺乳動(dòng)物、酵母、細(xì)菌等)中驅(qū)動(dòng)表達(dá),這在很大程度上取決于用于啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)子。
2)克隆質(zhì)粒:用于促進(jìn)DNA片段的克隆??寺≥d體往往非常簡(jiǎn)單,通常只包含細(xì)菌抗性基因、復(fù)制起點(diǎn)和MCS。
3)報(bào)告質(zhì)粒:用于研究遺傳元件的功能。這些質(zhì)粒包含一個(gè)報(bào)告基因(例如,熒光素酶或GFP),可提供遺傳元件活性的讀數(shù)。愛(ài)必信的快速多片段DNA組裝預(yù)混液(abs60250)可以直接用于報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建。同時(shí)我們還有一系列的熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒:abs60341、abs60342、abs60343、abs60344供大家選擇。
4)病毒質(zhì)粒:通過(guò)修飾的病毒基因組,有效地將遺傳物質(zhì)遞送到靶細(xì)胞中。可以使用這些質(zhì)粒來(lái)制造病毒顆粒,例如慢病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、AAV或腺病毒顆粒,從而高效感染靶細(xì)胞。
5)基因敲減質(zhì)粒:用于減少內(nèi)源基因的表達(dá)。通過(guò)表達(dá)靶向目的基因mRNA的shRNA來(lái)實(shí)現(xiàn)。這些質(zhì)粒具有可以驅(qū)動(dòng)短 RNA 表達(dá)的啟動(dòng)子。
6)基因工程質(zhì)粒:用于靶向和編輯基因組。通常使用CRISPR技術(shù)完成。
表1 本期小愛(ài)推薦產(chǎn)品
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 規(guī)格 |
abs60097 | Site-directed Mutagenesis Kit | 10T |
abs60100 | Multi Site-directed Mutagenesis Kit | 10T |
abs60104 | Random Mutagenesis Kit | 20T |
abs60085 | T-Vector快速克隆試劑盒 | 20T |
abs60089 | pBM21快速克隆試劑盒 | 20T/3×20T |
abs60090 | pBM22快速克隆試劑盒 | 20T/3×20T |
abs60091 | T-Vector pTOPO快速克隆試劑盒 | 20T/100T |
abs60094 | Blunt pTOPO快速克隆試劑盒 | 20T/100T |
abs60095 | pBM16A Toposmart快速克隆試劑盒 | 20T/3×20T |
abs60096 | pBM27 Toposmart快速克隆試劑盒 | 20T/3×20T |
abs60250 | 快速多片段DNA組裝預(yù)混液 | 50T |
abs60299 | 去內(nèi)毒素中大量質(zhì)粒提取試劑盒 | 20T/40T |
abs60300 | 去內(nèi)毒素中大量質(zhì)粒富集提取試劑盒 | 40T/60T |
abs60024 | 無(wú)內(nèi)毒素高純度質(zhì)粒大量快速提取試劑盒 | 10T |
abs60341 | 雙螢光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒 | 100T/1000T |
abs60342 | 螢火蟲(chóng)螢光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒 | 50T/200T/1000T |
abs60343 | 海腎螢光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒 | 50T/200T/1000T |
abs60344 | 一步法螢火蟲(chóng)螢光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒 | 50T/200T/1000T |
Absin特色產(chǎn)品線(xiàn):
WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、預(yù)制膠;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆;IP/CoIP試劑盒;激動(dòng)劑/抑制劑;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒;重組蛋白;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體、對(duì)照抗體;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...
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