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技術(shù)文章

原代細(xì)胞核心成分

閱讀:288          發(fā)布時(shí)間:2018-1-30

原代細(xì)胞核接頭蛋白LDB1是多蛋白轉(zhuǎn)錄復(fù)合體中的一個(gè)核心成分。Li等研究發(fā)現(xiàn), 在小鼠胚胎和成體造血干細(xì)胞中LDB1起到關(guān)鍵作用。在造血干細(xì)胞和前體細(xì)胞中敲除該基因會(huì)造成一些維持多能性相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄下調(diào), ChIP-Seq結(jié)果顯示, LDB1形成的復(fù)合體結(jié)合在這些基因的啟動(dòng)子區(qū)域, 暗示 LDB1維持造血干細(xì)胞中起核心作用。

多能造血前體細(xì)胞是一種干細(xì)胞樣細(xì)胞, 表達(dá)各種基因, 且有分化成包括免疫系統(tǒng)細(xì)胞在內(nèi)的大量不同類型血細(xì)胞的能力。Zhang等利用ChIPSeq和RNA-seq技術(shù)在小鼠全基因組內(nèi)找出造血前體細(xì)胞轉(zhuǎn)化成定型T細(xì)胞中起作用的所有基因, 并確定了每個(gè)基因在發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄時(shí)間點(diǎn)。同時(shí), 還追蹤了指引前體細(xì)胞到各種替代途徑中的基因。結(jié)果不僅揭示了T細(xì)胞發(fā)育過程的時(shí)空調(diào)控網(wǎng)絡(luò), 也表明了T細(xì)胞發(fā)育過程如何關(guān)閉啟動(dòng)替代命運(yùn)的基因。

少突膠質(zhì)細(xì)胞(oligodendrocyte, OL)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的髓鞘形成細(xì)胞, 原代細(xì)胞來源于其前體細(xì)胞。Olig2 是一種少突膠質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子, 與前體細(xì)胞增殖和向少突膠質(zhì)細(xì)胞分化密切相關(guān)。Yu等利用ChIPSeq進(jìn)行全基因組分階段研究發(fā)現(xiàn)Olig2充當(dāng)了一種預(yù)定位(prepatterning)因子, 引導(dǎo)染色質(zhì)重塑酶 Smarca4/Brg1到達(dá)少突膠質(zhì)細(xì)胞活性靶點(diǎn), 從而通過Brg1激活少突膠質(zhì)細(xì)胞特定基因表達(dá)。Olig2和Brg1在染色質(zhì)上的結(jié)合還指導(dǎo)重要的表觀遺傳修飾信息, 并預(yù)測(cè)重要的少突膠質(zhì)細(xì)胞分化調(diào)控基因。
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原代細(xì)胞

 

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