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更新時(shí)間:2024-11-02 21:00:07
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《Quick Cell探針法支原體檢測試劑盒》(Quick Cell qPCR Mycoplasma Detection Kit with Probe)采用支原體特異性引物和支原體特異性熒光探針(報(bào)告基因?yàn)镕AM),用于對(duì)樣品的支原體基因組DNA進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增檢測。試劑盒內(nèi)同時(shí)含有內(nèi)參對(duì)照質(zhì)粒mycoIC2和相應(yīng)的引物和熒光探針(報(bào)告基因?yàn)閂IC),用于監(jiān)控支原體DNA提取和qPCR擴(kuò)增的效率。本試劑盒可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:體外細(xì)胞培養(yǎng)的上清、血清、各種體液(如唾液、尿液、鼻腔分泌物)、別的液體樣品。
經(jīng)多次測試,本試劑盒有記錄可以識(shí)別在體外細(xì)胞培養(yǎng)中曾經(jīng)報(bào)道出現(xiàn)的20種支原體。根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,這些支原體基本上占污染細(xì)胞的支原體種類的100%。具體如下:(1)M. hyorhinis、(2)M. fermentans、(3)M. arginini、(4)M. hominis、(5)M. orale、(6)M. salivarium、(7)M.pirum、(8)A. laidlawii、(9)M. agalactiae、(10)M. bovis、(11) M. bovoculi、(12)A. axanthum、(13)M. buccale、 (14) M. pneumoniae、(15)M. arthritidis、(16)M. pulmonis、(17)M. gallisepticum、(18)M. gallinarum、(19)M. canis、(20)Ureaplasma urealyticum(注:M.為Mycoplasma的縮寫;A.為Acholeplasma的縮寫)。
訂購信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號(hào) | 規(guī)格 | 價(jià)格 |
Quick Cell探針法支原體檢測試劑盒 | AC16L068 | 50 T | 1980 |
產(chǎn)品組分
產(chǎn)品組分 | 規(guī)格 |
探針法溶液1P(50T) | 550 μL,含支原體和內(nèi)參檢測用引物及熒光探針 |
探針法溶液2T(50T) | 50 μL,酶溶液 |
內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2 | 500 μL |
去離子水 | 1.2 mL |
陽性支原體DNA | 50 μL |
【注】:①本試劑盒由于含有內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2(用于監(jiān)控支原體DNA提取和qPCR擴(kuò)增的有效性),客戶可以選擇進(jìn)行樣品支原體DNA的提?。▋?nèi)參質(zhì)粒mycoIC2在支原體DNA提取過程中加入),也可以選擇不進(jìn)行樣品支原體DNA的提?。▋?nèi)參質(zhì)粒mycoIC2直接加入樣品中)。
②本試劑盒的配套儀器可以是任何具有FAM和VIC檢測通道的熒光定量PCR儀。
運(yùn)輸與保存
藍(lán)冰運(yùn)輸。-20℃避光保存,有效期60個(gè)月。
使用方法
1.待測樣品的準(zhǔn)備
為了準(zhǔn)確判斷細(xì)胞是否有支原體的污染,待測的細(xì)胞培養(yǎng)液樣品需要取自換液后培養(yǎng)2-3 d 且匯合度在90%左右的細(xì)胞培養(yǎng)液上清(貼壁細(xì)胞)。懸浮培養(yǎng)的細(xì)胞也需要在換液傳代后,讓細(xì)胞生長2-3 d 再取培養(yǎng)液進(jìn)行檢測。可以按照以下兩種方法之一進(jìn)行樣品的前處理:
方法一:對(duì)樣品進(jìn)行支原體DNA的提取
(1)很多樣品(比如:培養(yǎng)很多天的細(xì)胞上清、血清、血漿等)由于含有抑制PCR擴(kuò)增的成分,如果樣品不進(jìn)行前處理而直接檢測,有可能導(dǎo)致qPCR擴(kuò)增失?。╭PCR結(jié)果:支原體通道和內(nèi)參對(duì)照通道均無擴(kuò)增曲線)。該類樣品建議客戶進(jìn)行樣品DNA提取(或者離心清洗,見后文方法二)后,再進(jìn)行檢測。提取DNA的過程有兩個(gè)作用:①可以*去除所有可能抑制PCR擴(kuò)增的成分,保證后續(xù)定量PCR擴(kuò)增的正常進(jìn)行;②具有濃縮支原體DNA的作用,可以提高相對(duì)檢測靈敏度10-100倍。
方法二:樣品不經(jīng)DNA提取(推薦本方法,不僅可以濃縮支原體從而提高相對(duì)檢測靈敏度,還可以去除絕大部分可能的抑制物,PCR擴(kuò)增被抑制的可能性極低)
(1)根據(jù)濃縮倍數(shù),可以取100 - 1500 μL上述待測樣品到1.5 mL離心管內(nèi),在普通臺(tái)式離心機(jī)上1000 rpm (大約150 g)低速離心5 min,將離心后的上清轉(zhuǎn)移到另一個(gè)離心管內(nèi),丟棄細(xì)胞沉淀。
(2)將上清繼續(xù)13000 rpm(約16000 g)高速離心5 min,小心吸走全部上清(勿碰到沉淀?。?0μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8(樣品可長期保存)重懸沉淀(沉淀中含有支原體),吹吸均勻(如果最初使用了1500 μL的樣品,則支原體濃度大約提高了30倍)。
(3)往50 μL重懸后的樣品中加入4 μL內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2(內(nèi)參質(zhì)粒融化后,請(qǐng)混勻后再吸取)。
(4)進(jìn)行熱處理后再檢測,具體如下:95 ℃加熱處理5 min(可以轉(zhuǎn)移到PCR管內(nèi),在PCR儀上進(jìn)行加熱處理),簡單離心(1000 g,5 s)后,取上清進(jìn)行檢測。
【注】:①這里的細(xì)胞培養(yǎng)上清不是指細(xì)胞經(jīng)胰酶消化后的離心上清,而是指至少培養(yǎng)2 d 后的貼壁細(xì)胞培養(yǎng)液上清(不需要胰酶消化,也不能取經(jīng)胰酶消化后的離心上清進(jìn)行檢測)或懸浮細(xì)胞培養(yǎng)液。
②本步驟的低速離心,需要嚴(yán)格控制在150-200 g,該離心力下哺乳動(dòng)物細(xì)胞將被沉淀下來而支原體不會(huì);否則,容易導(dǎo)致假陰性。
③收集的待測細(xì)胞培養(yǎng)液樣品如果不立即檢測,請(qǐng)放于-20℃或-80℃冰箱保存;為了節(jié)約檢測成本,可以將不同時(shí)間收集的樣品放于-20℃或-80℃冰箱保存,而后一起檢測。
2.熒光定量PCR體系的配制(本步驟所有操作建議使用濾芯吸頭,以避免試劑被污染)
將探針法溶液1P、陽性支原體DNA、去離子水從-20 ℃冰箱中取出,放室溫融化(也可以用手握住幫助融化)。探針法溶液1P和探針法溶液2T開蓋之前,請(qǐng)高速離心一下(5000 rpm,離心1 min)。探針法溶液2T不能在室溫長久放置,建議在-20 ℃冰箱直接吸取。
如果樣品總數(shù)為N(N=待測樣品數(shù)+1個(gè)陽性對(duì)照+1個(gè)陰性對(duì)照),qPCR反應(yīng)體系分為樣品經(jīng)DNA提取和不經(jīng)DNA提取兩個(gè)不同反應(yīng)體系,具體如下:
2.1 樣品進(jìn)行DNA提取后的反應(yīng)體系(在DNA提取過程中,必須按說明書加入內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2):
(1)反應(yīng)體系:
表1. 樣品經(jīng)DNA提取后的反應(yīng)體系
單個(gè)樣品體積(μL) | 樣品總數(shù) | 總體積(μL) | |
探針法溶液1P | 11 | N | 11×N×1.1 |
探針法溶液2T | 1 | N | 1×N×1.1 |
【注】:總體積中多配制10%,為了防止移液誤差;裝有陽性支原體DNA的螺口管請(qǐng)不要高速離心,開蓋之前,只要用手指捏住,用力甩一下即可。吸取之前,請(qǐng)吹吸均勻后再吸取。如果不小心高速離心了,務(wù)必吹吸均勻后再吸取,否則陽性對(duì)照結(jié)果可能異常。
【例】:如果待測樣品為8個(gè)(加上1個(gè)陰性和1個(gè)陽性對(duì)照),則樣品總數(shù)為10個(gè)。探針法溶液1P的總體積為11×10×1.1=121 μL,探針法溶液2T的總體積為1×10×1.1=11 μL。
(2)將上述2種溶液混合,吹打均勻后,按每管12 μL分裝到熒光定量PCR八聯(lián)管中。
(3)待測樣品管加入18 μL提取好的待測樣品DNA(樣品DNA加入量不能減少,否則內(nèi)參質(zhì)粒擴(kuò)增可能失敗);陰性對(duì)照管加入2 μL內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2(吹吸均勻后加入)和16 μL去離子水(為防止去離子水被污染,此處建議使用20 μL移液槍配合200 μL吸頭進(jìn)行吸取操作);陽性對(duì)照管加入2 μL陽性支原體DNA 和16 μL去離子水。每管反應(yīng)液的總體積為30 μL。
2.2 樣品不經(jīng)DNA提取的反應(yīng)體系:
(1)反應(yīng)體系:
表2. 樣品不經(jīng)DNA提取的反應(yīng)體系
單個(gè)樣品體積(μL) | 樣品總數(shù) | 總體積(μL) | |
去離子水 | 16 | N | 16×N×1.06 |
探針法溶液1P | 11 | N | 11×N×1.06 |
探針法溶液2T | 1 | N | 1×N×1.06 |
【注】:總體積中多配制6%,為了防止移液誤差,以保證每個(gè)反應(yīng)管中的反應(yīng)液足量;裝有陽性支原體DNA的螺口管請(qǐng)不要高速離心,開蓋之前,只要用手指捏住,用力甩一下即可。吸取之前,請(qǐng)吹吸均勻后再吸取。如果不小心高速離心了,務(wù)必吹吸均勻后再吸取,否則陽性對(duì)照結(jié)果可能異常。
【例】:如果待測樣品為8個(gè)(加上1個(gè)陰性和1個(gè)陽性對(duì)照),則樣品總數(shù)為10個(gè)。去離子水的總體積為16×10×1.06=169.6 μL 探針法溶液1P的總體積為11×10×1.06=116.6 μL,探針法溶液2T的總體積為1×10×1.06=10.6 μL。
(2)將上述3種溶液混合,吹打均勻后,按每管28 μL分裝到熒光定量PCR八聯(lián)管中。
(3) 待測樣品管加入2 μL未提取的待測樣品DNA,陰性對(duì)照管加入2 μL內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2(吹吸均勻后加入),陽性對(duì)照管加入2 μL陽性支原體DNA。每管反應(yīng)液的總體積為30 μL。
2.3 蓋上熒光定量PCR八聯(lián)管蓋子,去除反應(yīng)管中的大氣泡,3000-6000 rpm離心30 sec。
3.實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增
將PCR八聯(lián)管放入熒光定量PCR儀內(nèi),設(shè)置如下實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增程序:
表3. 熒光定量PCR擴(kuò)增程序
步驟 | 作用 | 循環(huán)數(shù) | 溫度 | 時(shí)間 | 收集熒光信號(hào) |
1 | 預(yù)變性 | 1 cycle | 95 ℃ | 30 sec | 否(No) |
2 | 預(yù)擴(kuò)增 (不收集熒光) | 5 cycles | 95 ℃ | 10 sec | 否(No) |
60 ℃ | 35 sec | 否(No) | |||
3 | 正式擴(kuò)增 (需要收集熒光) | 40 cycles | 95 ℃ | 10 sec | 否(No) |
60 ℃ | 35 sec | 是(Yes) |
【注】:支原體檢測熒光通道選擇FAM(Reporter: FAM,Quencher: None);內(nèi)參對(duì)照檢測熒光通道選擇VIC(Reporter: VIC, Quencher: None);反應(yīng)體積(Sample Volume)為30 μL;參考熒光(Passive Reference,只有ABI儀器需要設(shè)置)選擇None。
4.結(jié)果分析
4.1 ABI StepOne Plus 熒光定量PCR儀基線和閾值設(shè)定方法(其他熒光定量PCR儀的設(shè)置大同小異,請(qǐng)參考各自儀器說明書進(jìn)行設(shè)置):
(1)基線(Baseline)的設(shè)定:可以將Auto baseline前面的√ 去掉,然后手動(dòng)設(shè)置基線的起點(diǎn)為2(將剛開始熒光值不穩(wěn)定的幾個(gè)循環(huán)排除在基線之外。如果起點(diǎn)2不合適,可以適當(dāng)增減),終點(diǎn)為10左右。
(2)閾值(Threshold)線的設(shè)定:不同通道的閾值應(yīng)該分別設(shè)定。設(shè)定某個(gè)通道閾值線時(shí),首先選中含陰性對(duì)照的若干個(gè)樣品,去掉儀器勾選的自動(dòng)Threshold線,將其選項(xiàng)“√ Auto"改為“ Auto",然后手動(dòng)調(diào)整閾值線,以閾值線剛好超過正常陰性對(duì)照FAM通道擴(kuò)增曲線(無規(guī)則噪音線)的最高點(diǎn)為準(zhǔn)。
4.2 實(shí)驗(yàn)有效性判斷:
陽性對(duì)照管:其FAM通道有典型的S型擴(kuò)增曲線(即指數(shù)擴(kuò)增),其VIC通道的擴(kuò)增線呈直線或者S型曲線。
陰性對(duì)照管:其FAM通道的擴(kuò)增線呈直線,其VIC通道應(yīng)該有典型的S型擴(kuò)增曲線。
如果陽性對(duì)照管、陰性對(duì)照管同時(shí)滿足上述條件,則說明本次實(shí)驗(yàn)結(jié)果有效,否則實(shí)驗(yàn)結(jié)果無效。
典型的陰性直線型擴(kuò)增線和陽性S型擴(kuò)增曲線如圖1所示:
圖1. 典型的陰性直線型擴(kuò)增線(左)和陽性S型擴(kuò)增曲線(右)
4.3 待測樣品結(jié)果判斷:
待測樣品有可能出現(xiàn)以下4種組合:
表4. 待測樣品管FAM通道和VIC通道可能組合
組合 | FAM通道(測支原體) | VIC通道(測內(nèi)參) | 支原體污染判斷 |
1 | S型曲線 | S型曲線 | 支原體污染 |
2 | S型曲線 | 直線 | 支原體污染 |
3 | 直線 | S型曲線 | 無支原體 |
4 | 直線 | 直線 | PCR被抑制,結(jié)果無效 |
待測樣品管只要FAM通道有S型擴(kuò)增曲線(組合1和組合2)就說明有支原體污染。因?yàn)橥饧拥膬?nèi)參質(zhì)粒mycoIC2分子數(shù)極少,如果支原體含量很大時(shí),內(nèi)參質(zhì)粒的擴(kuò)增會(huì)被*抑制,導(dǎo)致內(nèi)參VIC通道無信號(hào)(組合2)。
如果待測樣品管FAM通道呈直線,而VIC通道有S型曲線(樣品的DNA提取過程和PCR擴(kuò)增過程均正常。由于提取過程中,外加的內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2分子數(shù)極少,作為內(nèi)參對(duì)照的VIC通道的Ct值會(huì)比較大),說明樣品無支原體。
如果陽性對(duì)照管和陰性對(duì)照管結(jié)果正常,而待測樣品管FAM通道和VIC通道均呈直線,說明PCR被抑制。如果樣品是經(jīng)過提取的,最可能原因是:DNA洗脫前,吸附膜中的乙醇沒有揮發(fā)*(解決方法:洗脫前,將吸附柱放50-65℃烘箱至少15 min)。如果樣品是沒有經(jīng)過提取的,則樣品本身含有抑制PCR的成分(解決方法:將樣品進(jìn)行DNA提取或者離心清洗)。此外,二者相同的可能原因有(此種情況發(fā)生概率很低,一般不需要考慮):內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2在運(yùn)輸和儲(chǔ)存中有部分降解,導(dǎo)致回收或者加入的內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2分子偏少,導(dǎo)致內(nèi)參VIC通道擴(kuò)增失?。ń鉀Q方法:將內(nèi)參質(zhì)粒mycoIC2的加入量增加到原來的2-4倍)。
【注】:陽性結(jié)果需要結(jié)合擴(kuò)增曲線(主要)和Ct值(次要)進(jìn)行判斷,不能只看Ct值(因熒光值的波動(dòng),個(gè)別陰性樣品雖然擴(kuò)增曲線基本呈直線,但可能會(huì)出現(xiàn)Ct值,此類樣品不能判斷為陽性。反之亦然:有些樣品有S型曲線,但是因?yàn)闊晒庵挡▌?dòng),導(dǎo)致沒有Ct值,此類樣品不能判斷為陰性)。
注意事項(xiàng)
本產(chǎn)品主要用于細(xì)胞上清支原體污染檢測,僅限于科學(xué)實(shí)驗(yàn)研究使用,不得用于臨床診斷、治療等領(lǐng)域
防DNA污染注意事項(xiàng):
(1)強(qiáng)烈建議所有操作(特別是qPCR體系配制步驟和吸取試劑盒中試劑的時(shí)候)使用濾芯吸頭進(jìn)行操作,以免試劑被污染。
(2)必須確保使用的移液槍本身沒有殘留的支原體。
(3)樣品前處理的各類吸頭、離心管,以及吸取陽性對(duì)照DNA、待測樣品DNA的吸頭,務(wù)必小心處理,請(qǐng)將其裝入含有半瓶水的帶蓋的、可密封的瓶子內(nèi),全部樣品吸取完后,蓋上瓶蓋,以防止陽性DNA的揮發(fā),造成環(huán)境的污染,進(jìn)而造成假陽性。整個(gè)操作過程,最好不要說話,因?yàn)槿说目谇缓屯僖憾际菐егw的。
(4)反應(yīng)后,請(qǐng)勿打開反應(yīng)管的蓋子,否則有可能造成檢測環(huán)境的污染。結(jié)果判斷完后,將其用自封袋密閉后,進(jìn)行適當(dāng)處理。
實(shí)驗(yàn)室必須嚴(yán)格分房間操作(本試劑盒建議在有窗戶、通風(fēng)良好的普通房間內(nèi)操作,請(qǐng)勿在密閉的房間操作。請(qǐng)勿在細(xì)胞培養(yǎng)間進(jìn)行該步驟的操作,因?yàn)榧?xì)胞培養(yǎng)間支原體污染概率很高):
試劑配制房間1:專門進(jìn)行定量PCR體系的配制(建議該房間全部使用進(jìn)口濾芯吸頭。)
DNA提取房間2:專門進(jìn)行支原體DNA的提取;
DNA加樣房間3:專門進(jìn)行定量PCR體系配制后,添加待測樣品、陽性對(duì)照、陰性對(duì)照等操作;
PCR擴(kuò)增房間4:進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增檢測。
【注】:如果房間緊張,可以考慮將房間2、房間3合并在一個(gè)房間,而房間1和房間4必須獨(dú)立。各房間物品(包括移液槍)均為專用,不得交叉使用。
如果出現(xiàn)qPCR的擴(kuò)增被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制時(shí)(qPCR結(jié)果:支原體通道和內(nèi)參對(duì)照通道均無擴(kuò)增曲線),可以采取以下幾種措施:
(1)將取樣的時(shí)間提前到換液后2 d或3 d,此時(shí)細(xì)胞上清的PCR擴(kuò)增抑制物相對(duì)比較少,一般不會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重的抑制。據(jù)我們測試,換液后5 d,PCR擴(kuò)增抑制物就已經(jīng)大量積累。
(2)用PBS對(duì)待測樣品進(jìn)行離心清洗,去除樣品中的抑制物。具體方法如下:取1 mL細(xì)胞上清,先13000 rpm離心5 min,吸走950 μL上清;加PBS 950 μL,再次離心,吸走950 μL上清;再加PBS 950 μL,第三次離心,吸走全部上清,用50 μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8 重懸沉淀,95 ℃加熱處理5 min,簡單離心(1000 g,5 s)后,取上清進(jìn)行檢測。但是該方法有如下缺點(diǎn):第一,如果樣品支原體含量較少,離心清洗可能導(dǎo)致漏檢,因?yàn)殡x心清洗過程中,可能導(dǎo)致支原體部分丟失。第二,個(gè)別樣品,即使經(jīng)過上述清洗也無法*去除抑制劑。
(3)抽提細(xì)胞上清的支原體DNA后再進(jìn)行PCR鑒定。
(4)使用李記生物的《Quick Cell支原體快速檢測試劑盒(細(xì)胞培養(yǎng)專用)》(貨號(hào):AC16L061)或者《Quick Cell 發(fā)光法支原體檢測試劑盒》(貨號(hào):AC16L062)進(jìn)行檢測,經(jīng)測試,未發(fā)現(xiàn)這兩種試劑盒會(huì)被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物所抑制。為了預(yù)防PCR的擴(kuò)增被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制的問題,也可以考慮將所有待測樣品全部進(jìn)行離心清洗或者DNA提取后,再使用本試劑盒進(jìn)行檢測。
支原體檢測樣品可以分成兩類:第一類,用含血清的培養(yǎng)液培養(yǎng)的哺乳動(dòng)物細(xì)胞上清液,由于該條件非常適合支原體生長,培養(yǎng)數(shù)天后,支原體密度一般較高,可達(dá)107-9/mL,可以直接檢測。第二類,低溫保存的血漿、血清、臍帶血、胰酶、抗生素、未使用的培養(yǎng)液等樣品,由于這些樣品即使有支原體污染,支原體含量一般很少,直接使用快速支原體檢測試劑盒進(jìn)行檢測,往往檢測不出來。這些樣品建議:(1)對(duì)樣品的支原體進(jìn)行離心濃縮將支原體DNA濃縮提取,該兩種方法大約可以將檢測靈敏度繼續(xù)提高10-100倍。該方法速度快,當(dāng)天出結(jié)果,但是可靠性不如后面的培養(yǎng)法。(2)使用支原體液體培養(yǎng)基(必須同時(shí)接種不含精氨酸和含精氨酸的兩種支原體液體培養(yǎng)基)培養(yǎng)3-7 d后,再進(jìn)行檢測。具體方法請(qǐng)參考李記生物《Quick Cell 發(fā)光法支原體檢測試劑盒》(貨號(hào):AC16L062)說明書中最后的注意事項(xiàng)部分。該方法速度較慢,需要3-7 d,但是可靠性高。
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