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cfDNA與無創(chuàng)產(chǎn)前基因篩查
閱讀:1775發(fā)布時間:2022-6-30
過去對于胎兒患染色體非倍體疾病的檢查手段是測量胎兒頸部皮膚透明帶厚度和羊水穿刺。頸部皮膚透明帶厚度測定準(zhǔn)確度很低,羊水穿刺培養(yǎng)細(xì)胞準(zhǔn)確度很高,但是會導(dǎo)致一定的流產(chǎn)風(fēng)險。同時穿刺檢測對于攜帶有某些傳染性疾病的孕媽,會增加胎兒感染疾病的風(fēng)險,因此可靠的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測一直是研究的重點
1997年,盧煜明團(tuán)隊運用PCR法擴(kuò)增母體外周血漿中的Y染色體特異DNA片段,證明在懷有男性胎兒的母血漿中存在胎兒游離DNA。,這是第一次證明該現(xiàn)象。該重要成果當(dāng)年發(fā)表在頂級醫(yī)學(xué)雜志《柳葉刀》(Lancet) ,即“Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum”
2010年,盧煜明教授團(tuán)隊又在Science Translational Medicine雜志發(fā)表文章,第一次證明母體外周血漿存在胎兒的全基因組信息,理論上證明了孕婦外周血游離DNA可以作為產(chǎn)前檢測的材料加以運用,為無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測奠定了理論基礎(chǔ)
2014年起,NIPT產(chǎn)品陸續(xù)獲得獲藥監(jiān)局認(rèn)證,無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測進(jìn)入快速發(fā)展階段。自2015年1月15日,國家衛(wèi)計委婦幼司發(fā)布了關(guān)于《產(chǎn)前診斷機構(gòu)開展高通量基因測序產(chǎn)前篩查與診斷技術(shù)臨床應(yīng)用試點工作的通知》,并審批通過了109家醫(yī)療機構(gòu)開展高通量基因測序產(chǎn)前篩查與診斷(NIPT)臨床試點以來,這一項技術(shù)在大江南北廣泛開展
無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測NIPT是利用高通量測序平臺,檢測胎兒染色體異常的新一代產(chǎn)前檢測技術(shù)。相對傳統(tǒng)的絨毛取樣或羊膜腔穿刺等具有“侵入性”的產(chǎn)前檢測方法而言,對母親外周血中的胎兒游離DNA進(jìn)行“非侵入性”產(chǎn)前檢測,結(jié)合生物信息分析計算出胎兒患染色體非倍體的疾病風(fēng)險。此技術(shù)能同時檢測常見的染色體三體綜合征:唐氏綜合征(T21)、愛德華氏綜合征(T18)、帕陶氏綜合征(T13),開辟了產(chǎn)前檢測的新篇章,有效補充了現(xiàn)有的產(chǎn)前篩查體系,成為目前主流的產(chǎn)前篩查方法。
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cfDNA(Cell free DNA )是人體細(xì)胞排放到血液里的DNA片段,長度在167bp上下,而cffDNA(cell-free fatel DNA)是來源于4孕周左右的胎盤脫落的胎盤絨毛膜細(xì)胞cfDNA,穿過胎盤屏障進(jìn)入母體的血液循環(huán)。cf-fDNA片段其具有胎兒全部的基因組信息,從懷孕第7周開始即可檢測到 cf-fDNA,具有妊娠特異性,且不受上次妊娠結(jié)果影響。
到目前為止,隨著cfDNA分析技術(shù)迅速發(fā)展,除了應(yīng)用于非整倍體遺傳病如21三體綜合征、性染色體連鎖性疾病如X染色體連鎖的血友病、脆性X綜合征等疾病的篩查外,還廣泛應(yīng)用于多種monogenic disease的產(chǎn)前篩查。
目前cfDNA檢驗應(yīng)用于臨床常規(guī)的瓶頸主要集中于方法學(xué)和樣本的質(zhì)量上。由于血漿中存在的靶cfDNA微乎其微,標(biāo)本的采集、抗凝劑使用和保存的不當(dāng)都會影響檢測的質(zhì)量,造成假陽性或假陰性的結(jié)果。并且cfDNA檢測對方法學(xué)要求*,雖然目前cfDNA的檢測方法都具有很高的敏感度和特異度,但是仍存在一些和傳統(tǒng)病理學(xué)或細(xì)胞遺傳學(xué)檢測結(jié)果不一致的情況。以產(chǎn)前篩查為例,對于NIPT檢測陽性的結(jié)果仍需經(jīng)過有創(chuàng)產(chǎn)前診斷的方法進(jìn)行證實,目前仍以細(xì)胞遺傳學(xué)的檢測結(jié)果作為金標(biāo)準(zhǔn)。
所以,優(yōu)化提取和檢測的方法,進(jìn)一步提高檢測cfDNA方法的靈敏度和特異性,縮短檢測的時間,降低檢測的成本還是亟待解決的問題。
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