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關(guān)鍵詞:454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測(cè)序服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)
簡(jiǎn)介:世界*品牌454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測(cè)序服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)原裝,質(zhì)量保證,*。
454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測(cè)序服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達(dá)體系。
我們具備豐富的蛋白表達(dá)設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)及實(shí)驗(yàn)操作技巧,承諾客戶(hù)不成功不收費(fèi)。在獲得重組蛋白產(chǎn)品的同時(shí),我們也會(huì)提供相應(yīng)的原始數(shù)據(jù)和原始圖片,不需要再額外花費(fèi)精力重復(fù)實(shí)驗(yàn)。另一方面,我們所有的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)真實(shí)可信,我們提供原始的表達(dá)菌株和克隆質(zhì)粒,客戶(hù)可以依據(jù)我們的實(shí)驗(yàn)報(bào)告重復(fù)我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
產(chǎn)品品牌:454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測(cè)序服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù) http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
實(shí)驗(yàn)描述
測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程:
1、文庫(kù)制備:根據(jù)樣品的種類(lèi)和實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,將基因組DNA/cDNA片段化處理至400-800bp間,經(jīng)末端修復(fù)與特異性接頭連接等修飾后變性處理回收單鏈的DNA(sstDNA);
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測(cè)序技
2、Emulsion PCR:特定比例的單鏈DNA文庫(kù)被固定在特別設(shè)計(jì)的DNA捕獲磁珠上,使大部分磁珠磁珠攜帶了一個(gè)*的單鏈DNA片斷。磁珠結(jié)合的文庫(kù)被擴(kuò)增試劑乳化,形成油包水的混合物,每個(gè)*的片斷在自己的微反應(yīng)器里進(jìn)行獨(dú)立的擴(kuò)增,而不受其他的競(jìng)爭(zhēng)性或者污染性序列的影響。整個(gè)片段文庫(kù)的擴(kuò)增平行進(jìn)行。擴(kuò)增后產(chǎn)生了幾百萬(wàn)個(gè)相同的拷貝。隨后,乳液混合物被打破,擴(kuò)增后仍結(jié)合在磁珠上的片段既可被回收純化用于后續(xù)的測(cè)序?qū)嶒?yàn);
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測(cè)序技
3、測(cè)序反應(yīng):攜帶DNA的珠子與其他反應(yīng)物混合物,隨后放入PTP板中進(jìn)行后繼的測(cè)序。PTP孔的直徑(29um)只能容納一個(gè)珠子(20um)。然后將PTP板放置在GS FLX中,測(cè)序開(kāi)始。每一個(gè)與模板鏈互補(bǔ)的核苷酸的添加都會(huì)產(chǎn)生化學(xué)發(fā)光的信號(hào),并被CCD照相機(jī)所捕獲;
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測(cè)序技
4、數(shù)據(jù)分析:GS FLX系統(tǒng)在10小時(shí)的運(yùn)行當(dāng)中可獲得100多萬(wàn)個(gè)讀長(zhǎng),讀取超過(guò)4-6億個(gè)堿基信息,通過(guò)GS FLX系統(tǒng)提供兩種不同的生物信息學(xué)工具對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。
技術(shù)特點(diǎn):
? 速度快,一個(gè)測(cè)序反應(yīng)耗時(shí)10個(gè)小時(shí),獲得4-6億(400-600M)個(gè)堿基對(duì)。比傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序的方法快100倍;
? 讀長(zhǎng)長(zhǎng),單個(gè)序列的讀長(zhǎng)更長(zhǎng),平均可達(dá)到450個(gè)堿基左右;
? 通量高,每個(gè)反應(yīng)可以得到超過(guò)100萬(wàn)個(gè)序列讀長(zhǎng),成本大大降低;
? 準(zhǔn)確度高,讀長(zhǎng)超過(guò)400bp時(shí),單一讀長(zhǎng)的準(zhǔn)確性可以超過(guò)99%;
? 一致性好,測(cè)序結(jié)果一致性超過(guò)99.99%;
? 可以進(jìn)行Pair-End測(cè)序研究;
? 簡(jiǎn)便,不需要進(jìn)行建庫(kù)、克隆挑取、質(zhì)粒提取等工作,一個(gè)人可以在一天內(nèi)完成一個(gè)微生物物種的測(cè)序工作。
GS FLX系統(tǒng)的應(yīng)用
全基因組測(cè)序
多達(dá)120 Mb的未知基因組的測(cè)序
-生成基因組結(jié)構(gòu)概圖
-研究DNA序列的組織,分布和信息
-基因篩查:尋找新基因,定位和功能
-和其他基因組進(jìn)行比較研究
全基因組進(jìn)行測(cè)序,例如微生物基因,BAC和YAC克隆測(cè)序。
比較基因組研究
-識(shí)別單堿基突變
-識(shí)別突變熱點(diǎn)和保守區(qū)域
-識(shí)別插入或者缺失的基因
-斷定基因型和表型之間的相關(guān)關(guān)系(比如,研究藥物抗性的遺傳基礎(chǔ))
- 基于基因測(cè)序變化進(jìn)行毒性預(yù)測(cè)
-進(jìn)行流行病學(xué)分析
-了解工業(yè)生產(chǎn)菌株和它們的親代菌株序列上的差異作為進(jìn)行工業(yè)生產(chǎn)菌株開(kāi)發(fā)的遺傳基礎(chǔ)
-進(jìn)行宏基因組 (metagenomics)研究
-古代化石DNA 測(cè)序研究
利用配對(duì)末端方法(Pair-End Tag)將Contigs拼接成Scaffolds。
轉(zhuǎn)錄組和基因調(diào)節(jié)研究
基于短Tags,ESTs, ChIP,或者GIS-PET序列的高通量轉(zhuǎn)錄組分析,或者miRNA 序列的基因組范圍識(shí)別,小分子和非編碼RNA的測(cè)序。
研究DNA的甲基化模式來(lái)進(jìn)行基因調(diào)節(jié)的研究。
擴(kuò)增產(chǎn)物分析
PCR產(chǎn)物的超精細(xì)測(cè)序(應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究的重測(cè)序)
-在混合的腫瘤樣本中識(shí)別體細(xì)胞突變
-在群體水平上發(fā)現(xiàn)高可信度的SNP位點(diǎn)
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