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Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit

Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit
參考價(jià) 9109
訂貨量 1
具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 型號(hào) RB4490
  • 品牌 HY StemCell/華雅干細(xì)胞
  • 廠商性質(zhì) 代理商
  • 所在地 重慶市

更新時(shí)間:2017-09-05 14:50:16瀏覽次數(shù):1855

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產(chǎn)品簡介
產(chǎn)地類別 進(jìn)口
Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit基于ThruPLEX技術(shù),并用于血漿來源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫構(gòu)建。Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit屬于胎兒染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒,含有靶向基因檢測(cè)試劑,該試劑專門針對(duì)cfDNA進(jìn)行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上,提升了文庫的信息容量。

Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit

 

Rubicon Genomics成立于2000年,總部位于美國密歇根州。該公司的核心競(jìng)爭力產(chǎn)品包括酶學(xué)、核酸化學(xué)、樣品的加工生產(chǎn),該公司致力于創(chuàng)新、知識(shí)產(chǎn)權(quán)的發(fā)展和持續(xù)的產(chǎn)品開發(fā)。

 

Rubicon Genomics開發(fā)創(chuàng)新、高品質(zhì)的、核酸文庫的制備及配套產(chǎn)品,ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit能夠?qū)εR床樣本進(jìn)行簡單、快速可靠和高靈敏度的分析。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測(cè)試劑產(chǎn)品說明:

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit基于ThruPLEX技術(shù),并用于血漿來源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫構(gòu)建。Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit屬于胎兒染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒,含有靶向基因檢測(cè)試劑,該試劑專門針對(duì)cfDNA進(jìn)行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上,提升了文庫的信息容量。文庫構(gòu)建后可用于CNV分析、全基因組測(cè)序分析或是采用一些panel針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit應(yīng)用于無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)、腫瘤無創(chuàng)檢測(cè)、cfDNA血漿游離DNA檢測(cè) 。

血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準(zhǔn)確的基因變異分析結(jié)果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價(jià)值高的特點(diǎn),深受研究腫瘤學(xué)或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit可與以雜交為基礎(chǔ)的靶序列富集系統(tǒng)組合使用。

1個(gè)反應(yīng)管、2小時(shí)、3步反應(yīng)的簡單操作(其中手動(dòng)操作只需要15分鐘),無中間純化步驟,無樣品轉(zhuǎn)移是必要的,從而防止處理錯(cuò)誤和有價(jià)值樣品的損失。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測(cè)試劑應(yīng)用

  • 胎兒染色體非整倍體檢
  • 無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)
  • 腫瘤無創(chuàng)檢測(cè)
  • cfDNA血漿游離DNA檢測(cè)

 

RB4490 血漿游離DNA檢測(cè)試劑訂購信息

品牌     Code No.  Takara No. 包裝量    產(chǎn)品名稱

 

Rubicon R400490     RB4490 12 Rxns  ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

 

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提供產(chǎn)品:華雅干細(xì)胞致力于為中國干細(xì)胞領(lǐng)域的干細(xì)胞科學(xué)研究、臍帶血/造血干細(xì)胞/臍帶/脂肪/胎盤干細(xì)胞庫、干細(xì)胞臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、干細(xì)胞美容及干細(xì)胞抗衰老、免疫細(xì)胞治療、T細(xì)胞治療、臨床干細(xì)胞治療等再生醫(yī)學(xué)和個(gè)體化治療產(chǎn)業(yè)鏈的相關(guān)客戶提供:MSC間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng)基、iPS/ES胚胎干細(xì)胞培養(yǎng)基、血清替代物、羊水培養(yǎng)基、基底膜基質(zhì)膠細(xì)胞支架、干細(xì)胞生長分化調(diào)控因子、BioMarker 流式檢測(cè)抗體、支原體檢測(cè)試劑盒、內(nèi)毒素檢測(cè)試劑盒、干細(xì)胞存儲(chǔ)細(xì)胞凍存袋、細(xì)胞培養(yǎng)瓶、USP級(jí)DMSO二甲基亞砜細(xì)胞凍存液、細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)試劑耗材儀器等種類豐富的產(chǎn)品,以“Focus on improving the quality of Stem Cells專注干細(xì)胞研究,提升干細(xì)胞品質(zhì)”為己任,我們與客戶攜手為中國干細(xì)胞產(chǎn)業(yè)的發(fā)展而前行。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測(cè)試劑產(chǎn)品組成

  • 模板準(zhǔn)備緩沖液(紅色)
  • 模板準(zhǔn)備酶(紅色)
  • 文庫合成緩沖液(黃色)
  • 文庫合成酶(黃色)
  • 文庫擴(kuò)增緩沖液(綠色)
  • 文庫擴(kuò)增酶(綠色)
  • 無核酸酶水
  • 索引試劑(藍(lán)色)
  • 使用方法

 

 

RB4490 血漿游離DNA檢測(cè)試劑原理

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit基于Rubicon Genomics的ThruPLEX技術(shù)含有靶向基因檢測(cè)試劑。與其它基于Y型適配器連接的NGS圖書館準(zhǔn)備工具不同,ThruPLEX使用莖環(huán)適配器在快速高效的工作流程中構(gòu)建高質(zhì)量的庫。在*步,模板制備時(shí),修復(fù)無細(xì)胞DNA(cfDNA)并產(chǎn)生具有鈍端的分子。在下一步中,具有封閉的5'端的銜接子以高效率連接到cfDNA的5'末端,留下切口目標(biāo)片段的3'末端。適配器不具有單鏈突出端并被阻止相互結(jié)合,這兩者都有助于與許多其他NGS發(fā)現(xiàn)的非特異性背景準(zhǔn)備工作。在zui后一步中,擴(kuò)增cfDNA的3'末端以完成文庫合成和光合作用索引通過高保真放大增加。任何剩余的免費(fèi)適配器被銷毀。ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit通過使用單管協(xié)議并消除實(shí)際操作時(shí)間和污染風(fēng)險(xiǎn)zui小化。

Rubicon血漿游離DNA檢測(cè)試劑盒ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit屬于胎兒染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒,含有靶向基因檢測(cè)試劑,適用于無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)、腫瘤無創(chuàng)檢測(cè)、cfDNA血漿游離DNA檢測(cè)。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測(cè)試劑工作流程:

  • 模板準(zhǔn)備有效修復(fù)輸入的無細(xì)胞DNA;
  • 用于連接Rubicon Genomics的莖環(huán)適配器的文庫合成;
  • 用于擴(kuò)展模板的庫擴(kuò)增,莖環(huán)接頭的切割以及放大文庫,還使用高保真度引入與Illumina兼容的索引,低偏差DNA聚合酶。  

 

 

圖1. ThruPLEX® 技術(shù)概要。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

ThruPLEX Plasma-seq Kit技術(shù)3步反應(yīng)即可完成針對(duì)cell free DNA的建庫工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進(jìn)行末端修復(fù)。通過采用莖環(huán)形接頭(無單鏈尾巴)進(jìn)行高效平端連接,降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解,進(jìn)一步降低背景。高保真度擴(kuò)增的方式完成以上反應(yīng),并獲得含有illumina index的文庫。

 

 

圖2. 高cfDNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit構(gòu)建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

圖中針對(duì)0.1ng、1ng、30ng的cell-free DNA,使用ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit、A公司試劑盒和C公司試劑盒制備文庫,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測(cè)定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測(cè)序,每個(gè)樣品得到約17-25 M read(PE)。每個(gè)文庫在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后,計(jì)算Duplication rates。重復(fù)read比例以每個(gè)樣品17M計(jì)算。

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit與其他公司試劑盒相比,針對(duì)不同input量,使用本試劑盒制備的文庫相比其他公司試劑盒制備的文庫,本試劑盒制備的文庫的多樣性(左圖)是zui高的,重復(fù)read的比例(中間圖)、unmapped read的比例(右圖)較其他公司低。通過使用本試劑盒,input量很低時(shí)也可制備得到高品質(zhì)的文庫。在無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)、腫瘤無創(chuàng)檢測(cè)、cfDNA血漿游離DNA檢測(cè)等領(lǐng)域ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit優(yōu)于其他產(chǎn)品,深受胎兒染色體非整倍體檢測(cè)和腫瘤學(xué)科研工作者的重視。

 

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圖3. 優(yōu)異的靶向測(cè)序文庫構(gòu)建能力。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫通過panel進(jìn)行高效捕獲,對(duì)kinome進(jìn)行深度測(cè)序分析以檢測(cè)突變。分別以5 ng、6.5 ng、10 ng 3個(gè)血漿樣品為起始建庫量,三次重復(fù)。目標(biāo)區(qū)域經(jīng)SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進(jìn)行捕獲,并用Illumina Miseq平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,每個(gè)文庫獲得5 M reads,目標(biāo)堿基被成功捕獲分析。在30x覆蓋度時(shí),平均77%的堿基被覆蓋。 

 

圖4. 高重復(fù)性的、無偏倚的GC覆蓋度。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

針對(duì)人類基因組,ThruPLEX Plasma-seq Kit表現(xiàn)出高再現(xiàn)性、低偏倚GC覆蓋度NGS文庫構(gòu)建能力。9次獨(dú)立的血漿樣品文庫構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,ThruPLEX重復(fù)性高于其它產(chǎn)品。文庫的制備是利用的1 mL血漿來源cfDNA,后續(xù)采用illumina NextSeq 500進(jìn)行測(cè)序。作為對(duì)比,NEBNext Ultra構(gòu)建了4份獨(dú)立血漿樣品的文庫。

 

圖5. Karolinska協(xié)會(huì)和CRUK測(cè)試的結(jié)果。

(*以上數(shù)據(jù)來源于Karolinska 協(xié)會(huì),瑞典)

5 ng游離cf DNA采用ThruPLEX Plasma seq Kit進(jìn)行illumina文庫構(gòu)建。結(jié)果表明利用Hiseq平臺(tái)進(jìn)行的Low-pass WGS,每個(gè)文庫能獲得接近12.5 M reads。無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)、腫瘤無創(chuàng)檢測(cè)、cfDNA血漿游離DNA檢測(cè)科研工作者的重視。 

 

ThruPLEX® Plasma-seq Kit 胎兒染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒

  • 專為cfDNA設(shè)計(jì):經(jīng)過優(yōu)化的修復(fù)及連接試劑
  • 高品質(zhì)NGS文庫:在寬廣的GC含量范圍內(nèi),可以達(dá)到高檢測(cè)再現(xiàn)性
  • 起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量
  • 快速簡便:無需純化或樣品轉(zhuǎn)移的單管、2小時(shí)、3步操作步驟
  • 應(yīng)用領(lǐng)域:液態(tài)活檢、ctDNA、目標(biāo)區(qū)域測(cè)序等領(lǐng)域文庫構(gòu)建
  • 兼容自動(dòng)化平臺(tái):Beckman® FXP Workstation
  • Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測(cè)序試劑盒應(yīng)用于:胎兒染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)、腫瘤無創(chuàng)檢測(cè)、cfDNA血漿游離DNA檢測(cè) 、靶向基因檢測(cè)試劑。

 

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