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種子的SSR檢測(cè)——高通量前處理解決方案

閱讀:2309發(fā)布時(shí)間:2016-11-29

美國(guó)SPEX SamplePrep公司擁有60余年的專業(yè)樣品前處理儀器生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn)和專業(yè)背景。SPEX GENO高通量組織研磨儀,開(kāi)始是專門(mén)為杜邦旗下先鋒良種農(nóng)業(yè)(PIONEER)植物樣品而研發(fā)。

SSR(又稱微衛(wèi)星DNA)標(biāo)記,由于其共顯性遺傳特點(diǎn),可以鑒定雜合子和純合子。該標(biāo)記法需要DNA量少,實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好,可靠性高,操作簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì),因而已經(jīng)成為種子鑒定中zui常用的分子鑒定方法,并已經(jīng)出現(xiàn)在一些種子真實(shí)性和純度檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)中。

為了真正實(shí)現(xiàn)*通量檢測(cè),在96孔深孔板的單孔中如能對(duì)單粒種子成功粉碎將是非常理想的。我們知道要將種子磨碎并不難,但要在如此狹小的空間內(nèi)將堅(jiān)硬的種子磨碎就不那么容易實(shí)現(xiàn)了。SPEX高通量組織研磨儀能輕松達(dá)到這一目的。培安公司應(yīng)用工程師已整理出上百種樣品的*前處理方案,下圖為部分種子的研磨效果(每個(gè)圖都是96孔深孔板單孔研磨單粒種子的結(jié)果):

 

 

值得注意的是,大麥、綠豆、黃豆這些帶皮的種子,無(wú)須剝皮,研磨完成外皮自然脫落;像黃豆這樣堅(jiān)硬的種子,在單孔也成功粉碎;像葵花籽這樣油性的種子,研磨結(jié)果雖有些結(jié)塊,但是也呈泥漿狀,擁有很好的細(xì)度。玉米種子單粒較大,無(wú)法放入深孔板單孔中,但當(dāng)我們將玉米種子放入15ml管中,也獲得了下圖的研磨效果:

   

我們知道,在進(jìn)行種子真實(shí)性和純度檢測(cè)時(shí),每個(gè)品種需要做一定數(shù)量的重復(fù),尤其純度檢測(cè)時(shí),至少需要100粒種子。在SSR分子標(biāo)定步驟的*步就需要破碎種子并提取DNA,這是一個(gè)非常繁重的手工勞動(dòng)。如果SPEX Geno 加入工作,就可以一個(gè)人在幾分鐘之內(nèi)就獲得所有待測(cè)種子的模板DNA!而這往往是需要一個(gè)人幾個(gè)工作日的勞動(dòng)量!

Geno 2010一次可處理696孔深孔板,也就是說(shuō)一次即可完成576個(gè)種子的DNA提取;一次可處理24個(gè)15ml管,像玉米這樣的大顆粒種子,一次也可以做24個(gè)不同樣品的DNA提取。

種子檢測(cè)領(lǐng)域和遺傳育種領(lǐng)域的樣品通量*是*的,也是讓科研工作者頗為傷腦筋的問(wèn)題。培安技術(shù)中心的應(yīng)用工程師可根據(jù)您的樣品為您提供方案,使得所有繁瑣的前處理問(wèn)題迎刃而解。

愿培安公司專業(yè)的前處理儀器和技術(shù)服務(wù)能早日為您的科研事業(yè)添磚加瓦。

 


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