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上新！一種新型固相烷基化試劑，助力高效處理蛋白組學(xué)樣本
閱讀：746發(fā)布時(shí)間：2023-10-31
背景
蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平、亞細(xì)胞定位、翻譯后的修飾、蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生、細(xì)胞代謝、生長(zhǎng)發(fā)育以及各種脅迫反應(yīng)等過(guò)程的整體而全面的知識(shí)。
隨著生物質(zhì)譜技術(shù)迅速發(fā)展，質(zhì)譜技術(shù)已經(jīng)逐漸成為了蛋白質(zhì)組學(xué)分析的主流技術(shù)。質(zhì)譜儀器具有高靈敏度、高分辨率等特點(diǎn)，樣本前處理的質(zhì)量和可重復(fù)性顯著影響質(zhì)譜儀的分離和鑒定能力。
蛋白質(zhì)組學(xué)樣本前處理流程復(fù)雜、處理時(shí)間長(zhǎng)（傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組前處理需過(guò)夜），造成了樣品前處理不穩(wěn)定、樣品質(zhì)量參差不齊，重現(xiàn)性差等問(wèn)題，急需一種高效、高回收率、抗干擾能力強(qiáng)的蛋白質(zhì)組學(xué)分析的前處理方法。
蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程
產(chǎn)品介紹
?？萍瘓F(tuán)全新推出的蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒，其中的關(guān)鍵組分是一種新型固相烷基化試劑，與傳統(tǒng)的烷基化試劑相比，采用新型固相烷基化試劑，蛋白質(zhì)可與其它小分子（如糖、鹽、表面活性劑、脂類等）實(shí)現(xiàn)快速分離，提高蛋白質(zhì)的純度，顯著降低樣本復(fù)雜程度。同時(shí)，試劑表面親水性較好，可顯著提高蛋白質(zhì)或酶解產(chǎn)物的回收率。產(chǎn)品適用于處理各種來(lái)源的蛋白質(zhì)組樣品，如細(xì)胞、血漿、細(xì)菌、腫瘤組織等
?？频鞍捉M學(xué)樣本前處理試劑盒
（新型固相烷基化試劑）
產(chǎn)品特點(diǎn)
一、高效
操作簡(jiǎn)便、高效，一站式覆蓋蛋白質(zhì)組提取到消化的所有步驟
二、高回收率
蛋白質(zhì)組處理回收率高，可滿足納克至微克級(jí)別蛋白質(zhì)組樣品的處理需求
三、抗干擾
抗干擾能力強(qiáng)，對(duì)樣品中表面活性劑、有機(jī)試劑、各種酸堿緩沖溶液等均可耐受
四、適配自動(dòng)化
除手動(dòng)操作外，可適配?？谱詣?dòng)化前處理設(shè)備
產(chǎn)品測(cè)試數(shù)據(jù)
使用試劑盒對(duì)293T細(xì)胞處理后進(jìn)行重復(fù)性驗(yàn)證
材料：用 6M 鹽酸胍超聲裂解 293T 細(xì)胞離心獲得
實(shí)驗(yàn)方法：隨機(jī)選取2批次試劑，將同一樣品分為6份，每批次試劑各做3個(gè)平行樣品，使用蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒流程處理后，將樣品進(jìn)行Q Exactive質(zhì)譜檢測(cè)。
Q Exactive質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果如下：
表1：不同批次前處理試劑處理293T蛋白樣品QE質(zhì)譜檢測(cè)蛋白數(shù)及零漏切率
圖1：不同批次試劑處理293T蛋白樣品質(zhì)譜檢測(cè)重復(fù)性Pearson Correlation Coefficient均＞0.99
使用試劑盒對(duì)E. coli 樣本處理后進(jìn)行重復(fù)性驗(yàn)證
材料：用 6M 鹽酸胍超聲解 E. coli 離心獲得
實(shí)驗(yàn)方法：隨機(jī)選取2批次試劑，將同一樣品分為6份，每批次試劑各做3個(gè)平行樣品，使用蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒流程處理后，將樣品進(jìn)行Q Exactive質(zhì)譜檢測(cè)。
Q Exactive質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果如下：
表2：不同批次前處理試劑處理E.coli蛋白樣品QE質(zhì)譜檢測(cè)蛋白數(shù)及零漏切率
圖2：不同批次試劑處理E.coli 蛋白樣品質(zhì)譜檢測(cè)重復(fù)性Pearson Correlation Coefficient均＞0.99
■ 實(shí)驗(yàn)總結(jié)
對(duì)293T 細(xì)胞和E. coli 樣本分別用兩批次試劑進(jìn)行前處理，批間的重復(fù)性測(cè)試表明可檢測(cè)到的蛋白數(shù)及零漏切率基本一致，達(dá)到預(yù)期要求；檢測(cè)結(jié)果皮爾斯相關(guān)系數(shù)介于0.991-0.996之間。說(shuō)明不同批次試劑實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)性好。
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