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1. 實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮鸵?/span>
通過本實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)氯化鈣法制備大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞和外源質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)入受體菌細(xì)胞的技術(shù)以及篩選轉(zhuǎn)化體的技術(shù)。了解細(xì)胞轉(zhuǎn)化的概念及其在分子生物學(xué)研究中的意義。
2. 相關(guān)知識及原理
感受態(tài)細(xì)胞(Competent cells):
受體細(xì)胞經(jīng)過一些特殊方法(如:CaCl2,RuCl等化學(xué)試劑法)的處理后,細(xì)胞膜的通透性發(fā)生變化,成為能容許多有外源DNA的載體分子通過的感受態(tài)細(xì)胞(competent cell) 。
轉(zhuǎn)化(transformation):
是將異源DNA分子引入一細(xì)胞株系,使受體細(xì)胞獲得新的遺傳性狀的一種手段,是基因工程等研究領(lǐng)域的基本實(shí)驗(yàn)技術(shù)。
進(jìn)入細(xì)胞的DNA分子通過復(fù)制表達(dá),才能實(shí)現(xiàn)遺傳信息的轉(zhuǎn)移,使受體細(xì)胞出現(xiàn)新的遺傳性狀。轉(zhuǎn)化過程所用的受體細(xì)胞一般是限制-修飾系統(tǒng)缺陷的變異株,即不含限制性內(nèi)切酶和甲基化酶的突變株。
轉(zhuǎn)化的方法:
化學(xué)的方法(熱擊法):使用化學(xué)試劑(如CaCl2)制備的感受態(tài)細(xì)胞,通過熱擊處理將載體DNA分子導(dǎo)入受體細(xì)胞;
電轉(zhuǎn)化法:使用低鹽緩沖液或水洗制備的感受態(tài)細(xì)胞,通過高壓脈沖的作用將載體DNA分子導(dǎo)入受體細(xì)胞。
克隆的篩選:
主要用不同抗生素基因篩選。常用的抗生素有:氨芐青霉素、卡那霉素、氯霉素、四環(huán)素、鏈霉素等;將經(jīng)過轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞在選擇性培養(yǎng)基中培養(yǎng),才能較容易地篩選出轉(zhuǎn)化體,即帶有異源DNA分子的受體細(xì)胞。否則,如果將轉(zhuǎn)化后的菌液涂在無選擇性抗生素的培養(yǎng)基平板上,會出現(xiàn)成千上萬的細(xì)菌菌落,將難以確認(rèn)哪一個(gè)克隆含有轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒。雖然只有那些含有被轉(zhuǎn)化質(zhì)粒的細(xì)菌才能在含有抗生素的平板上生長和繁殖,但對于連接混合物而言,此時(shí)并不能確定哪個(gè)克隆含有插入片段。
重組質(zhì)??寺〉蔫b定
鑒定帶有重組質(zhì)??寺〉姆椒ǔS玫挠?/span>a- 互補(bǔ)、小規(guī)模制備質(zhì)粒DNA進(jìn)行酶切分析、插入失活、PCR以及雜交篩選的方法。zui常用的方法是小規(guī)模制備質(zhì)粒DNA進(jìn)行酶切分析,對于帶有LacZ基因的載體還可以結(jié)合a-互補(bǔ)現(xiàn)象來篩選。
a-互補(bǔ)現(xiàn)象:
因?yàn)樵S多載體都帶有一個(gè)LacZ基因的調(diào)控序列和頭146個(gè)氨基酸的編碼信息,編碼a-互補(bǔ)肽,該肽段能與宿主編碼的缺陷型a-半乳糖苷酶實(shí)現(xiàn)基因內(nèi)互補(bǔ)(a-互補(bǔ))。當(dāng)這種載體轉(zhuǎn)入可編碼β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主細(xì)胞中時(shí),在異丙基β-D硫代半乳糖苷(IPTG)的誘導(dǎo)下,宿主可同時(shí)合成這兩種肽段,雖然它們各自都沒有酶活性,但它們可以融為一體形成具有酶活性的蛋白質(zhì)。所以稱這種現(xiàn)象為a-互補(bǔ)現(xiàn)象。
由互補(bǔ)產(chǎn)生的β-半乳糖苷酶(LacZ)能夠作用于生色底物5-溴-4-氯-3-吲哚-b-D-半乳糖苷(X-gal)而產(chǎn)生藍(lán)色的菌落,所以利用這個(gè)特點(diǎn),在載體的該基因編碼序列之間人工放入一個(gè)多克隆位點(diǎn),當(dāng)插入一個(gè)外源DNA段時(shí),會造成LacZ(a-)基因的失活,破壞a-互補(bǔ)作用,就不能產(chǎn)生具有活性的酶。所以,有重組質(zhì)粒的菌落為白色,而沒有重組質(zhì)粒的菌落為藍(lán)色。
3.儀器、材料和試劑
無菌超凈臺,電熱恒溫水浴,分光光度計(jì),離心機(jī),移液器,微型離心管等;
菌株:E.coli DH5α
質(zhì)粒:pBluscript KS+DNA 片段的質(zhì)粒以及 pBluscript KS 空質(zhì)粒;
LB培養(yǎng)基;含抗菌素的LB平板培養(yǎng)基(氨芐青霉素,濃度50-100µg/mL,X-gal 20-48µg/ml, IPTG 100 µg/ml。一般將抗生素、X-gal和IPTG配制成1000µl儲備液,用時(shí)按培養(yǎng)基的量再加入);預(yù)冷CaCl2溶液(0.1mol/L)
.操作步驟
1)大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的制備(CaCl2法)
(1) 從新活化的E.coli DH5α菌平板上挑取一單菌落,接種于3~5ml LB液體培養(yǎng)中,37℃振蕩培養(yǎng)12h左右,直至對數(shù)生長期。將該菌懸液以1:100~1:50轉(zhuǎn)接于100ml LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩擴(kuò)大培養(yǎng),當(dāng)培養(yǎng)液開始出現(xiàn)混濁后,每隔20~30min測一次OD600nm,至OD600nm≤0.5時(shí)停止培養(yǎng);
(2) 每組取培養(yǎng)液3個(gè)2ml轉(zhuǎn)入2ml離心管中,在冰上冷卻20-30min,于4℃,4000r/min離心10min(從這一步開始,所有操作均在冰上進(jìn)行,速度盡量快而穩(wěn));
(3) 倒凈上清培養(yǎng)液,用1ml冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液輕輕懸浮細(xì)胞,冰?。?/span>
(4) 0~4℃,4000r/min離心10min;
(5) 棄去上清液,加入500µll冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液,小心懸浮細(xì)胞。0~4℃,4000r/min離心10min;
(6) 棄去上清液,加入100µl冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液,小心懸浮細(xì)胞,冰上放置片刻后,即制成了感受態(tài)細(xì)胞懸液;
(7) 制備好的感受態(tài)細(xì)胞懸液可直接用于轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),也可加入占總體積15%左右高壓滅菌過的甘油,混勻后分裝于1.5ml離心管中,置于-70℃條件下,可保存半年至一年。
(1) 從新活化的E.coli DH5α菌平板上挑取一單菌落,接種于3~5ml LB液體培養(yǎng)中,37℃振蕩培養(yǎng)12h左右,直至對數(shù)生長期。將該菌懸液以1:100~1:50轉(zhuǎn)接于100ml LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩擴(kuò)大培養(yǎng),當(dāng)培養(yǎng)液開始出現(xiàn)混濁后,每隔20~30min測一次OD600nm,至OD600nm≤0.5時(shí)停止培養(yǎng);
(2) 每組取培養(yǎng)液3個(gè)2ml轉(zhuǎn)入2ml離心管中,在冰上冷卻20-30min,于4℃,4000r/min離心10min(從這一步開始,所有操作均在冰上進(jìn)行,速度盡量快而穩(wěn));
(3) 倒凈上清培養(yǎng)液,用1ml冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液輕輕懸浮細(xì)胞,冰?。?/span>
(4) 0~4℃,4000r/min離心10min;
(5) 棄去上清液,加入500µll冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液,小心懸浮細(xì)胞。0~4℃,4000r/min離心10min;
(6) 棄去上清液,加入100µl冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液,小心懸浮細(xì)胞,冰上放置片刻后,即制成了感受態(tài)細(xì)胞懸液;
(7) 制備好的感受態(tài)細(xì)胞懸液可直接用于轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),也可加入占總體積15%左右高壓滅菌過的甘油,混勻后分裝于1.5ml離心管中,置于-70℃條件下,可保存半年至一年。
2)細(xì)胞轉(zhuǎn)化
(1) 分別取3個(gè)100µl感受態(tài)細(xì)胞懸液(如是冷凍保存液,則需化凍后馬上進(jìn)行下面的操作),*組,加入10 µl重組質(zhì)粒DNA(體積不超過10µl) 100µl感受態(tài)細(xì)胞,此管為轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)組。第二組,插入DNA段對照組,即酶切后DNA段25ng 100µl感受態(tài)細(xì)胞懸液;第三組,質(zhì)粒DNA對照組,即1ng 未酶切pBluescript 質(zhì)粒DNA十100µl感受態(tài)細(xì)胞懸液。
(2) 將以上各樣品輕輕搖勻,冰上放置20-30min,于42℃水浴中保溫1-2min,然后迅速冰上冷卻2min
(3) 立即向上述管中分別加入0.4ml LB液體培養(yǎng)基(不需在冰上操作),使總體積到0.5ml,該溶液稱為轉(zhuǎn)化反應(yīng)原液,搖勻后于37℃振蕩培養(yǎng)約45-60min ,使受體菌恢復(fù)正常生長狀態(tài),并使轉(zhuǎn)化體表達(dá)抗生素基因產(chǎn)物(Ampr)。
(1) 分別取3個(gè)100µl感受態(tài)細(xì)胞懸液(如是冷凍保存液,則需化凍后馬上進(jìn)行下面的操作),*組,加入10 µl重組質(zhì)粒DNA(體積不超過10µl) 100µl感受態(tài)細(xì)胞,此管為轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)組。第二組,插入DNA段對照組,即酶切后DNA段25ng 100µl感受態(tài)細(xì)胞懸液;第三組,質(zhì)粒DNA對照組,即1ng 未酶切pBluescript 質(zhì)粒DNA十100µl感受態(tài)細(xì)胞懸液。
(2) 將以上各樣品輕輕搖勻,冰上放置20-30min,于42℃水浴中保溫1-2min,然后迅速冰上冷卻2min
(3) 立即向上述管中分別加入0.4ml LB液體培養(yǎng)基(不需在冰上操作),使總體積到0.5ml,該溶液稱為轉(zhuǎn)化反應(yīng)原液,搖勻后于37℃振蕩培養(yǎng)約45-60min ,使受體菌恢復(fù)正常生長狀態(tài),并使轉(zhuǎn)化體表達(dá)抗生素基因產(chǎn)物(Ampr)。
3) 平板培養(yǎng)(有時(shí)需要稀釋)
(1) 取各樣品培養(yǎng)液0.1ml,分別接種于含抗菌素LB平板培養(yǎng)基上,涂勻(如果用玻璃棒涂抹,酒精燈燒過后稍微涼一下再用,不要過燙)。
(2) 菌液*被培養(yǎng)基吸收后,倒置培養(yǎng)皿,于37℃恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)過夜(12-16小時(shí)),待菌落生長良好而又未互相重疊時(shí)停止培養(yǎng),對于可以藍(lán)白斑篩選的質(zhì)粒和菌株來說,此時(shí)應(yīng)該能清楚地看到藍(lán)色和白色菌落。
(1) 取各樣品培養(yǎng)液0.1ml,分別接種于含抗菌素LB平板培養(yǎng)基上,涂勻(如果用玻璃棒涂抹,酒精燈燒過后稍微涼一下再用,不要過燙)。
(2) 菌液*被培養(yǎng)基吸收后,倒置培養(yǎng)皿,于37℃恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)過夜(12-16小時(shí)),待菌落生長良好而又未互相重疊時(shí)停止培養(yǎng),對于可以藍(lán)白斑篩選的質(zhì)粒和菌株來說,此時(shí)應(yīng)該能清楚地看到藍(lán)色和白色菌落。
用 CaCl2法制備的感受態(tài)細(xì)胞,可使每微克超螺旋質(zhì)粒 DNA產(chǎn)生5×106-2×107個(gè)轉(zhuǎn)化菌落。在實(shí)際工作中,每微克有105以上的轉(zhuǎn)化菌落足以滿足一般的克隆實(shí)驗(yàn)。
4) 檢出轉(zhuǎn)化體和計(jì)算轉(zhuǎn)化率
統(tǒng)計(jì)每個(gè)培養(yǎng)皿中的菌落數(shù),各實(shí)驗(yàn)組培養(yǎng)皿內(nèi)菌落生長狀況應(yīng)如表所示:
各實(shí)驗(yàn)組在培養(yǎng)皿內(nèi)菌落生長狀況及結(jié)果分析
統(tǒng)計(jì)每個(gè)培養(yǎng)皿中的菌落數(shù),各實(shí)驗(yàn)組培養(yǎng)皿內(nèi)菌落生長狀況應(yīng)如表所示:
各實(shí)驗(yàn)組在培養(yǎng)皿內(nèi)菌落生長狀況及結(jié)果分析
轉(zhuǎn)化體總數(shù)=菌落數(shù)×(轉(zhuǎn)化反應(yīng)原液總體積/涂板菌液體積)
插入頻率=藍(lán)色菌落數(shù)/白色菌落數(shù)
轉(zhuǎn)化頻率=轉(zhuǎn)化體總數(shù)/加入質(zhì)粒DNA的量(計(jì)算出每微克的轉(zhuǎn)化菌落數(shù))
插入頻率=藍(lán)色菌落數(shù)/白色菌落數(shù)
轉(zhuǎn)化頻率=轉(zhuǎn)化體總數(shù)/加入質(zhì)粒DNA的量(計(jì)算出每微克的轉(zhuǎn)化菌落數(shù))