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烷基鏈類PROTAC 連接子

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烷基鏈類PROTAC 連接子
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烷基鏈類PROTAC 連接子

西安瑞禧生物科技有限公司經(jīng)營(yíng)的產(chǎn)品包括有:磷脂、分子聚乙二醇衍生物、嵌段共聚物、磁性納米顆粒、納米金及納米金棒、近紅外熒光染料、活性熒光染料、熒光標(biāo)記的葡聚糖BSA和鏈霉親和素、蛋白交聯(lián)劑、小分子PEG衍生物、點(diǎn)擊化學(xué)產(chǎn)品、樹枝狀聚合物、環(huán)糊精衍生物、大環(huán)配體類、熒光量子點(diǎn)、透明質(zhì)酸衍生物、石墨烯或氧化石墨烯、碳納米管、富勒烯,二氧化硅及介孔二影產(chǎn)品,熒光蛋白及熒光探針等等。


烷基鏈類PROTAC 連接子

連接鏈長(zhǎng)度對(duì)PROTAC分子降解效率的影響︰在 PROTAC分子連接靶蛋白和E3酶發(fā)揮作用時(shí),兩者間會(huì)產(chǎn)生基于蛋白的相互作用,這種相互作用會(huì)影響PROTAC分子本身的穩(wěn)定性,還會(huì)影響PROTAC分子的降解效率。通過(guò)改變PROTAC的分子結(jié)構(gòu)使蛋白的弱相互作用變強(qiáng)。通過(guò)改變PORTAC分子的連接鏈的長(zhǎng)度和位置,來(lái)改變?nèi)獜?fù)合物的底物構(gòu)象從而改變其相互作用強(qiáng)度。以dBET23(1)以及dBET6(2)這兩種連接鏈結(jié)合位點(diǎn)不同的PROTAC為起始研究對(duì)象,分別改變了連接鏈的長(zhǎng)度,將得到的PROTAC分子與蛋白結(jié)合后進(jìn)行時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移分析( time-resolved fluorescence resonanceenergy transfer,TR-FRET),觀測(cè)蛋白間的相互作用受到的影響。

 

結(jié)果連接鏈長(zhǎng)度較短的 PROTAC分子dBET57(3)相較于dBET6(2),通過(guò)改變蛋白接近時(shí)的構(gòu)象,改變了CRBN 與BRD4相互作用的殘基,削弱了兩者的蛋白相互作用。在dBET23(1)的基礎(chǔ)上改變了連接鏈的原子數(shù),得到了對(duì)于一系列高度同源的BRD蛋白具有選擇性的PROTAC小分子化合物ZXH-3-26 。具有較短連接鏈的PROTAC分子選擇性高,其原因是連接鏈長(zhǎng)度適當(dāng)縮短后,具有較短連接鏈的ZXH-3-26(4)與蛋白結(jié)合時(shí),產(chǎn)生了不同于該組設(shè)計(jì)的其他PROTAC分子的構(gòu)象,限制了BRD與CRBN間產(chǎn)生穩(wěn)定性相互作用的構(gòu)象數(shù)目,從而具有選擇性。 

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3-Maleimidopropionic acid、3-Mercaptopropionic acid NHS ester4-(6-Methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)phenol、4-(N-Boc-amino)-1,6-heptanedioic acid、4-Boc-amino-2,2-dimethylbutyric acid、4-Bromobutylphosphonic acid、4-Maleimidobutyric acid、5-(Biotinamido)pentylamine、5-(Biotinamido)pentylazide

 

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雜合雙功能PROTAC小分子連

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PROTAC雙功能Ligand

PROTAC雙功能Ligand for E3 Li

PROTAC技術(shù)ubiquit

PROTAC技術(shù)ubiquitin-proteas

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