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蛋白marker的作用是什么，先要要了解一下什么是蛋白marker。在Western Blot過程中，分子量Marker就像個螺絲釘一樣沒雖然是個小細節(jié)，然而就是這樣一個小細節(jié)對實驗結(jié)果有著不可忽視的作用。
      蛋白marker的作用：
      Marker是表面覆蓋有特殊反光材料的標記物，常見形狀有球形、半球形。染色體上一個可以被識別的區(qū)域（比如限制性內(nèi)切酶的酶切點，基因的位置等）。標記的遺傳能夠被檢測出來。標記可以是染色體上有表達功能的部分（比如基因），也可以是沒有編碼蛋白質(zhì)功能但遺傳特性能夠被檢測出來的部分。其次，蛋白marker可分為未預染的Marker即寬分子量蛋白標準、高分子量蛋白標準以及低分子量蛋白標準以及預染的Marker即單色預染和多色預染。
      預染蛋白分子量標準
      預染蛋白分子量是一些純化好的蛋白混合物，通過與染料共價耦聯(lián)，在電泳過程中或者轉(zhuǎn)膜時可以直接觀察到。預染蛋白分子量的出現(xiàn)方便了我們的實驗，這種蛋白分子量標準可以幫助我們在電泳時、電泳后，以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測電泳情況和估計遷移率。值得注意的是預染蛋白Marker與染料共價耦聯(lián)，所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發(fā)生某些變化，可能導致一些偏差，所以不太適合定位蛋白——不過多數(shù)情況下Marker的條帶未必能和我們的目標蛋白*一樣，我們得到的也不過是一種相對Marker指示的參考大小，后都需要Western來定性，所以如果不是要區(qū)分大小相近的條帶，預染Marker還是很好用的，而且也可以和未染色的蛋白標準一起使用。
      蛋白分子量標準可以分成未染蛋白分子量標準、預染蛋白分子量標準二個。蛋白標準還有表示轉(zhuǎn)移成功或者蛋白在凝膠上的電泳程度等等的作用，所以選擇正確的蛋白Marker也是western blot實驗成功的必要條件之一。以上就是今天要介紹的蛋白marker的作用。