高溫消毒又分為高溫干熱消毒和高溫濕熱滅菌。高溫濕熱由于蒸汽潛熱大，穿透力強(qiáng)，容易使蛋白質(zhì)變性或凝固，因此該法的滅菌效率比干熱滅菌法高。其原因有三：1)蛋白質(zhì)凝固所需的溫度與其含水量有關(guān)，含水量愈大，發(fā)生凝固所需的溫度愈低。濕熱滅菌的菌體蛋白質(zhì)吸收水分，所以較同一溫度的干熱空氣中易于凝固。2)濕熱滅菌過程中蒸汽放出大量潛熱，加速提高濕度。因而濕熱滅菌比干熱所需溫度低，如在同一溫度下，則濕熱滅菌所需時間比干熱短。3)濕熱的穿透力比干熱大，使其深部也能達(dá)到滅菌溫度，故濕熱比干熱收效好一些。所以高溫消毒并不是簡單的看消毒溫度，主要是看是否濕熱消毒。

    另外，從使用角度看，濕熱消毒一般控制在90℃就能達(dá)到很*的消毒效果，整個消毒過程中培養(yǎng)箱內(nèi)的所有附件都不用取出，可以全部進(jìn)行消毒；而干熱消毒為了達(dá)到較好的效果，溫度一般都在100℃以上，在這種溫度下消毒培養(yǎng)箱內(nèi)的傳感器、HEPA過濾器等都要在消毒過程中取出，等消毒結(jié)束再裝上，這樣即麻煩，附件又不能同時消毒，而且增加二次污染的幾率，再者要達(dá)到100℃以上的高溫，培養(yǎng)箱的加熱系統(tǒng)的電熱絲必然要加粗，這會導(dǎo)致培養(yǎng)箱的溫度控制難度增加，均一性變差。所以用戶在選購二氧化碳培養(yǎng)箱時選擇含高溫濕熱滅菌方式的培養(yǎng)箱。