TRAP-PCR銀染法端粒酶活性檢測試劑盒
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- 公司名稱 南京賽泓瑞生物科技有限公司
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- 更新時間 2017/7/20 8:38:49
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TRAP-PCR銀染法端粒酶活性檢測試劑盒
凱基TRAP-PCR銀染法端粒酶活性檢測試劑盒
(TRAP-silver staining omerase Detection Kit )
Cat number:KGA412 For Research Use Only
Store at-20℃ for one year
Expire date:20101208
一、試劑盒說明
端粒酶是合成染色體末端的端粒的酶。端粒(omere)是真核生物染色體的天然末端,由上千個6堿基重復(fù)序列組成(TTAGGG)組成,是細(xì)胞必需的遺傳組分,它的作用是維持端粒有足夠的長度,保證基因信息在復(fù)制過程的準(zhǔn)確性,以防止染色體末端遺傳信息的丟失。在正常情況下,每個細(xì)胞分裂周期都會使端粒變得越來越短,當(dāng)端粒短到一定程度就會發(fā)出信號,細(xì)胞停止分類。
端粒酶由RNA和蛋白質(zhì)亞基組成,是基本的核蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶,在細(xì)胞染色體復(fù)制過程中,能夠以自身RNA為模板,在染色體3’末端合成重復(fù)序列,維持端粒的長度。正常人體細(xì)胞中不能檢測出端粒酶活性的表達(dá),而腫瘤細(xì)胞株及大多數(shù)腫瘤組織中的端粒酶活性卻異常的高表達(dá)。因此對組織或細(xì)胞中端粒酶活性的檢測具有重要意義。TRAP-銀染法端粒酶活性檢測試劑盒是采用端粒重復(fù)序列擴(kuò)增的方法,利用銀染技術(shù)檢測端粒酶的活性。陽性結(jié)果在凝膠電泳上顯示相隔6 bp的梯狀條帶,條帶的深淺表示端粒酶活性的大小。TRAP-銀染法保留了傳統(tǒng)TRAP法靈敏度高、特異性強(qiáng)等優(yōu)點,同時縮短了檢測所需的時間,避免了同位素的放射污染。
本試劑盒適用于培養(yǎng)細(xì)胞及新鮮組織端粒酶活性檢測,與通常的端粒酶活性測定法相比較,具有以下特征:
內(nèi)標(biāo)與端粒酶提取液在同一管中進(jìn)行PCR擴(kuò)增,提高了檢測的準(zhǔn)確性;
優(yōu)化引物設(shè)計,是PCR效果進(jìn)一步提高
二、試劑盒組份
組份 | KGA412 (20 assays) | KGA413 (50 assays) | KGA414 (100 assays) | 儲存條件 |
Wash buffer | 20 mL | 50 mL | 100 mL | 40C |
Lysis buffer | 1.2mL | 3.0 mL | 5.0 mL | 40C |
10×TRAP buffer | 100μL | 250μL | 500μL | 40C |
dNTPs | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
Taq-DNA polymerase | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
TS primer | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
CX primer | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
內(nèi)標(biāo)引物 | 20μL | 50μL | 100μL | -200C |
20μL | 50μL | 100μL | -200C |
三、試劑盒以外自備儀器和試劑
高速冷凍離心機(jī)、渦旋振蕩儀、PCR擴(kuò)增儀、微量移液器、DEPC水處理并滅菌的槍頭、離心管等
PBS、1M DTT、PMSF(100mM溶于異丙醇)、0.5Mβ-巰基乙醇、DEPC水
蛋白定量試劑及儀器(可選購凱基Bradford法或BCA蛋白濃度測定試劑盒)
聚丙烯酰胺凝膠電泳、銀染相關(guān)儀器及試劑(具體參見操作方法)
四、操作方法
建議使用經(jīng)DEPC水處理并滅菌的槍頭、離心管等實驗器材
1. 細(xì)胞端粒酶或組織標(biāo)本端粒酶的提取
1.1 用PBS洗滌細(xì)胞二次(離心2000rpm,5min)收集1~2×106細(xì)胞;若是組織標(biāo)本,稱取40-100mg左右的組織,用PBS洗滌后,研碎;
1.2 加入1ml冰冷的Wash buffer (使用前每ml Wash buffer中加入1μL 1M的DTT),懸浮上述樣品,置冰上5min;
1.3 4oC,離心 (10,000 rpm,5min),棄上清;
1.4 加入40μL冰冷的Lysis buffer [使用前每ml Lysis buffer中加入2μLβ-巰基乙醇(0.5M溶于水,一般市售純液體為14.3M)],懸浮沉淀,渦旋振蕩10s,置冰上30min,其中間隔數(shù)分鐘,渦旋振蕩一次,共3~5次;
1.5 4oC,離心 (13,000 rpm,30min);
1.6 轉(zhuǎn)移上清,分裝3-4管,每管約20μL。其中一份樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)濃度測定,其余迅速冷凍,-70℃保存。
1.7 濃度測定后,根據(jù)結(jié)果zui后用Lysis buffer調(diào)濃度至1μg /μL,用于下一步實驗。
2. PCR擴(kuò)增
1.1 吸取2.5μL 10×TRAP buffer,另加入0.5μL dNTPs, 0.5μL TS primer,2μL端粒酶提取物,然后加入19.5μL ddH2O,于PCR擴(kuò)增儀上23 oC保溫30min;
注:蛋白上樣范圍較廣,可從10ng~10μg,建議根據(jù)實際情況調(diào)整。
1.2 上述各管中加94℃加熱1分鐘滅活。
1.3 向上述各管中加入2.5μL 10×TRAP buffer,0.5μL dNTPs,0.5μL TS primer,1μL CX primer,0.5μL Taq-DNA polymerase,18μL ddH2O,混勻,于PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行擴(kuò)增:
94 °C,3 min;
94 °C,30s;45°C,35s;72 °C,90s;5個循環(huán);
72 °C,延伸60s。
1.4 在上述擴(kuò)增結(jié)束時,暫停儀器運行,快速向各管中加入內(nèi)標(biāo)模板1μL,內(nèi)標(biāo)引物1μL。繼續(xù)運行儀器,進(jìn)行以下的擴(kuò)增實驗:
94 °C,60s;
94 °C,40s;60°C,35s;72 °C,50s;35-36個循環(huán);
72 °C,延伸10min。
以下步驟的試劑需用戶自備:
3. 聚丙烯酰胺凝膠電泳
3.1 制備10%非變性聚丙烯酰胺凝膠(20ml)
37%Acr-Bis(36:1) | 5.46 ml |
ddH2O | 12.4 ml |
10×TBE | 2 ml |
10%APS | 125μL |
TEMED | 15μL |
3.2 電壓17.5V/cm,電泳Buffer:0.5×TBE,所制凝膠垂直電泳預(yù)跑1-2小時;
3.3 取9μL PCR產(chǎn)物加上1μL 10×上樣緩沖液,在電壓17.5V/cm,10%非變性聚丙烯酰胺凝膠垂直電泳50~60min;
4. 銀染
4.1 將凝膠置10%乙酸固定30min,然后用蒸餾水漂洗3次,每次5min;
4.2 將凝膠置于0.2 g/L硫代硫酸鈉浸泡1min,然后用蒸餾水漂洗3次,每次30s;
4.3 將凝膠置于硝酸銀染液浸泡30min,然后用蒸餾水漂洗15s;
4.4 將凝膠置于顯色液中顯色10min左右直到全部條帶顯色為止;
4.5 zui后將凝膠置于10%乙酸浸泡5min終止反應(yīng)。
用戶自備試劑配方:
硝酸銀染液(100mL) 10×上樣緩沖液(10mL)
0.2g 硝酸銀 25mg 溴酚蘭
25μL 37%甲醛 4g 蔗糖
定容至100mL 定容至10mL
10×TBE(pH=8.3) (100mL) 顯色液(100mL)
10.8g Tris 3g 碳酸鈉
5.5g 硼酸 25μL 37%甲醛
4ml 0.5M EDTA 0.4mg 硫代硫酸鈉
定容至100mL 定容至100mL
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