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LncRNA芯片定制檢測服務(wù)

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LncRNA芯片定制檢測服務(wù)

 

實(shí)驗(yàn)技術(shù)簡介:長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA, IncRNA) 是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt、 不編碼蛋白的RNA。IncRNA起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來的研究表明IncRNA能在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因表達(dá),參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程,與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治都有著密切聯(lián)系。

雖然越來越多的IncRNA被發(fā)現(xiàn),但是人們現(xiàn)在了解到的IncRNA只是冰山一角,絕大部分的IncRNA的功能仍然是不清楚的。目前主要通過IncRNA芯片或新-代測序等方法對IncRNA進(jìn)行功能研究。 現(xiàn)階段,基因芯片技術(shù)發(fā)展趨于成熟穩(wěn)定,在此平臺上,通過設(shè)計(jì)不同的IncRNA探針,可以更加快速、高通量地篩選出疾病或特定生物學(xué)過程中差異表達(dá)的IncRNAmRNA信息,最終找到IncRNA的靶基因 位點(diǎn)深入分析調(diào)控機(jī)制。

 

實(shí)驗(yàn)操作流程:

1、樣品RNA抽屜、質(zhì)檢

2、cDNA/aRNA樣品合成和標(biāo)記

3、芯片雜交

4、洗滌、染色、掃描

5、圖像采集和數(shù)據(jù)分析

IncRNA芯片數(shù)據(jù)- -IncRNA差異 表達(dá)基因的篩選一對IncRNA重新注釋mRNA差異表達(dá)基因的篩選-G0分析,pathway分析IncRNAmRNA共表達(dá)分析

 

客戶提供:

1、實(shí)驗(yàn)對象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,使用

BioPulverizerTM冰凍粉碎組織,加1mRNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen),使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。

2、實(shí)驗(yàn)對象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1x106 ~ 1x107細(xì)胞,加1mRNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細(xì)胞,每10cm2培養(yǎng)皿TRIzo使用量為1m),裂解后抽提RNA。

 

交付標(biāo)準(zhǔn):

1、芯片檢測數(shù)據(jù)

2、完整的實(shí)驗(yàn)操作規(guī)程、實(shí)驗(yàn)報(bào)告 (含軟件分析結(jié)果)以及實(shí)驗(yàn)材料


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