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創(chuàng)騰科技專注于生命科學和材料科學領域信息化的開拓與創(chuàng)新。通過 AI 及移動互聯(lián)技術，我們?yōu)閺V大用戶提供：計算模擬與數(shù)據(jù)建模、科研創(chuàng)新及質量合規(guī)等*的信息化解決方案，全面提升企業(yè)的研發(fā)效能和數(shù)字化轉型價值。在中國，已有千余家生命科學和材料科學領域的機構選擇了創(chuàng)騰科技的產(chǎn)品和服務，包括國內的制藥企業(yè)、新藥研發(fā)合同服務企業(yè)、石化企業(yè)以及高校、科研院所。
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Neosuite TCMD 中藥化學數(shù)據(jù)庫

   TCMdb 產(chǎn)品簡介   
Neosuite TCMD 中藥化學數(shù)據(jù)庫（ Traditional Chinese Medicines Database , TCMdb ）是中科院過程工程研究所分子設計課題組在*從事藥物設 計方法研究的背景下，對數(shù)據(jù)庫工具的國內外需求進行分析，經(jīng)多年努力研制成功的科學數(shù)據(jù)庫產(chǎn)品，是一個支持新藥研發(fā)和中藥現(xiàn) 代化研究的新型工具。
TCMdb 是一個多學科交叉的科學數(shù)據(jù)庫，涉及中藥現(xiàn)代化研究、中藥化學、藥物化學、植物化學、化學信息學、中藥藥理學、分子藥 理學、藥物設計學、耕產(chǎn)物研究與開發(fā)、新藥創(chuàng)制、新劑型中藥研發(fā)、新農(nóng)藥及其它農(nóng)用化學品的研發(fā)等諸多研究及開發(fā)領域。

數(shù)據(jù)翔實，表達規(guī)范，檢素途徑完備

*的中藥新產(chǎn)品開發(fā)和現(xiàn)代化研究綜合信息源

收集化合物 23033 種
涉及中藥藥用植物 6735 種
使用參考文獻 5538 篇（部）
文獻延伸到 2010 年

每種化合物含下列數(shù)據(jù)：唯yi代碼、中文名稱、英文名稱、CAS登錄號、分子式、分子量、物理化學性質（晶體形態(tài)、焰點、 沸點、旋光度等）、格式化的生物活性數(shù)據(jù)（即藥理模型實驗結果）、含有該化合物的中藥名單（部分包括該化合物在原 植物中的含量數(shù)據(jù)）、含*立體化學信息的結構式和參考文獻。

   化合物信息舉例：人參皂甙 Rd   
ID : 8427
CAS : 52705 - 93 - 8
name_cn ：人參皂昔 Rd
name_en ：Ginsenoside Rd
MF : C48H82O18
MW : 947.1779
source_plant ：絞股藍 Gynostemma pentaphyllum（ 葉 ：0.009% 干重 ）[4757]，秦嶺珠子參 Panax japonicus van major，人參 Panax ginseng [Syn. Panax schinseng]，三七花蕾 Panax pseudo-ginseng var. notoginseng [Syn. Panax notoginseng]（ 花蕾：0.010% 干重 ）[4702]，西洋參 Panax quinquefolium，竹節(jié)三七 Panax pseudo-ginseng var. japonicus （ 地下部分：0.0018% 干重 ）[4647].
physical_chemical ：白色粉末（ 乙醇：正丁醇=1 : 1）, mp 206 ~ 209°C, [ α ] D22 = +19.38° （ c = 1.03,甲醇 ）.
other_name : Gypenoside VIII
pharm_avtivity ：抗心律失常（ 氯化鋇引起的大鼠心律不齊 ）；抗病毒；抑制 HSV - 1復制；抗氧化劑（ 大鼠肝臟勻漿，過氧化氫所致，IC50 = （ 12.0±0.8 ）pg/mL，FeSO4 所致，IC50 = （ 457.5 ± 15.4）μg/mL ）; 11-β-羥番類脫氫酶抑制劑；cAMP 磷酸二酯酶抑制劑 （ in vitro, IC50 = 84μmol/L ）；促進柔紅霉素和長春花堿的細胞毒作用；促進皮質酮血漿分泌（ ED50 = 112pmol/kg ）;調節(jié)腎功能 和抑制腎小球再生；血管擴張劑；抗痛覺活性（ i.t. 注射 0.7μg 物質 -P 誘導的疼痛模型，EC = 50μg i.t. ）[5474]；保肝（ 抑制巨噬細胞活化，抑制 sALT 和 sAST 水平的升高，in vivo，D-GalN / 脂多糖誘導的小鼠肝損傷，100mg/kg ip 對 sALT，抑制率= 97%; 100mg/kg ip 對 sAST，抑制率 = 93%；對照氫化可的song，20mg/kg ip 對 sALT，抑制率 = 99%；20mg/kg ip 對 sAST，抑制率 = 97% ）[4702].
Ref : 4，87，451，900，4647，4702，4757，5474.

   TCMdb 產(chǎn)品特點   

8000 種成分有藥理數(shù)據(jù) ：
200 種細胞水平抗癌模型；細胞因子網(wǎng)絡調節(jié)機制抗炎模型；各種抗氧化模型；各種酶抑制劑模型；NO 抑制劑模型等等。

信息表達體系完整嚴格 ：
按規(guī)范全面定義了中英名稱、化學結構、各類數(shù)值、生物活性等數(shù)據(jù)結構、層次及格式，使相關學科信息表達和接軌。

保證數(shù)據(jù)*性可靠性 ：
采用多種交叉驗證方法保證信息準確可靠。化合物立體化學表達完整，并*實現(xiàn)了藥理數(shù)據(jù)多層次結構規(guī)范化。
安裝簡便易用：
安裝在通用的 ISIS Base 平臺上，在 Windows 環(huán)境下運行，用戶檢索、瀏覽和輸出方便自如。同時也可方便地和 BIOVIA 等其他分子設計軟件相連接。

   TCMdb 主要功能和用途   

 • 多途徑的文字及數(shù)據(jù)檢索功能；含立體化學的二維結構檢索功能。

 • 進行 QSAR 研究的豐富的數(shù)據(jù)源；也是用綜和方法研究中藥現(xiàn)代化的有用工具。

 • 從系統(tǒng)的中草藥有效成分結構信息出發(fā)，發(fā)現(xiàn)新先導，進而創(chuàng)制新西藥的有用工具。

 • 從中草藥資源出發(fā)，研發(fā)新劑型等新中藥產(chǎn)品的有用工具。

 • 多構象三維結構數(shù)據(jù)庫可直接用于藥物設計，可用來進行基于藥效團的三維結構數(shù)據(jù)庫搜尋，或是進行基于分子對接的數(shù)據(jù)庫搜尋。

從中藥設計新西藥的有用工具
研發(fā)新劑型新中藥的必留工具

能回答和中藥相關的種種問題，是管理者決策的好參謀！研發(fā)者工作的好工具！臨床者案頭的好幫手！
 - 某屬/種植物中有哪些化學成分已被分離鑒定？都有何種藥理活性？
 - 有多少化學成分做過抗癌實驗，哪些有活性?哪些沒有? IC50 值多少？
 - 以心血管藥物為研發(fā)目標的公司應該關注哪些中藥的研發(fā)動態(tài)？
 - 從中藥出發(fā)創(chuàng)制抗高血壓新藥，哪些資源成功希望大？
 - 開發(fā)某種新劑型中藥時，從哪些資源出發(fā)較有開發(fā)前景？
 - 已經(jīng)確定了三維藥效團，能否從中藥成分中確定先導化合物？
 - 有哪些結構類型的化合物具有某種藥理活性（1000 多種選項）?
 - 黃酮類化合物有多少種藥理活性?哪些活性zui強？哪些活性譜較廣?
 - 臨床常用某種中藥材抗心律失常，其藥理學的根據(jù)何在?
 - 中藥傳統(tǒng)藥效有清熱、安神、解表、活血等，對應的藥理學概念是什么?

   TCMdb 應用實例   
 ♦ 從植物檢素化合物
給定一種中藥藥用植物，問該種植物都含有哪些化合物 ？ 嚴格的說法是：都有哪些化合物被從該種植物中分離并進行了結構確定 ？TCMdb 數(shù)據(jù)庫能方便地完成這個任務。以三七為例，單擊菜單欄下方的 “Query” 按鈕，在 query 模式下激活 “植物來源” 域，鍵入 “Like “%三七%” ” 時，單擊菜單欄 “Search” 按鈕，單擊下拉菜單中的 “By Form” ，系統(tǒng)將擴展地檢出各種三七中含有的全部化合物，包括竹節(jié)三七等。

 ♦ 化合物藥理活性數(shù)據(jù)檢索
在全庫的 23033 種化合物中，8000 種化合物有藥理活性數(shù)據(jù)。這是研究 QSAR/SAR 關系的珍貴信息。用 SBF 方式，激活 “藥理活性” 域后，鍵入 “Like “%藥理關鍵字%” ” ，之后單擊菜單欄 “Search” 按鈕，單擊下拉菜單中的 “By Form” ，就得到下表中的結果。亦可采用 QB 方式，見下表中中間的三個例子：
 

注意 : 體外抗癌活性在庫中的規(guī)范表達方式是 “細胞毒” ，體內抗癌活性在庫中的規(guī)范表達方式是 “抗腫瘤” 。觀察化合物生物活性索引中的生物活性規(guī)范表達方式對于熟練使用數(shù)據(jù)庫是有好處的。

 

 ♦ 結構檢索
結構及子結構檢索是 TCMdb *的功能。這一功能的實現(xiàn)對進行 QSAR 研究，進而研發(fā)新藥提供了巨大的幫助。這里只舉出較簡單的例子：將黃酮類化合物的特征分子骨架放入 SBF 方式下的 structure 檢索域，從庫中檢出包含黃酮骨架的化合物 1101 個。具體命令見 2.2 節(jié)。用 β-D-葡萄糖的分子骨架 ( 含確切的立體化學信息 ) 提問，得到 4438 個命中化合物。其它例子見下表：
 

   TCMdb 用戶評價   
繼中文專著一一《中藥原植物化學成分集》三卷本（ ISBN978-7-03-023553-4 ）由科學出版社于 2009 年出版以后，與本數(shù)據(jù)庫內容*匹配的英文專著一一六卷本《中藥大全-分子結構，藥理活性，天然來源及應用》（《Encyclopedia of Traditional Chinese medicines Molecular Structures, Pharmacological Activities, Natural Sources and Applications》，Vol 1~Vol 6，ISBN978-3-642-16734-8）已于 2011 年由 Springer 出版社在發(fā)行。但文字 / 數(shù)值 / 結構復合型數(shù)據(jù)庫具有任何紙質書本不可能具有的強大檢索功能，和《中藥原植物化學成分集》配合使用，相得益彰，是*的結合。

國內中醫(yī)、中藥、藥理專家對《中藥原植物化學成分集》一書的評論摘要：

"該書為中藥的現(xiàn)代化研究搭建了一個很好的信息平臺，達到了上同類工作的*水平"

―（醫(yī)科院藥用植物所肖培根院士）

"該書內容豐富，資料完整，反映了國內外研究成果，對于充分利用翔國中藥資源，促進中藥現(xiàn)代 化研究，提升我國創(chuàng)新藥物研究水平，具有重要的科學價值"

―（中國藥理學會杜冠華理事長）

"該書為用綜合方法系統(tǒng)研究中藥*提供了一套兩萬種以上中藥化學成分的數(shù)據(jù)集合，在理論層面上對 臨床實踐有皿參考價值"。

―（中醫(yī)*翁維良*研究員）

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