核酸凝膠染料

核酸凝膠染料

GelRed and Gelgreen
zui靈敏 , zui穩(wěn)定的核酸凝膠染色試劑，是真正的EB替代產(chǎn)品！

由美國BIOTIUM公司技術(shù)專家研發(fā)的GelRed 和GelGreen 是兩種集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身的的熒光核酸凝膠染色試劑。其水溶染色劑通過美國環(huán)保局安全認(rèn)定，廢棄物可直接倒入下水道，而不會造成任何環(huán)境污染。

目前大多數(shù)商業(yè)化的核酸染料（凝膠染色試劑）總是在安全性、穩(wěn)定性和靈敏性等方面不*令人滿意。例如，雖然 EB （溴化乙啶）作為目前使用zui廣泛的核酸凝膠染色試劑，能夠在多數(shù)應(yīng)用中提供可以接受的靈敏度，但它是一種高誘變性的化學(xué)物質(zhì)。而且EB染色后具有較高的背景熒光信號。SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為zui靈敏的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微堿性電泳緩沖溶液或預(yù)制凝膠中會快速降解，穩(wěn)定性差導(dǎo)致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認(rèn)為是市場上較為安全的核酸染料 ，但它的染色效果還遠(yuǎn)不及 SYBR Green I 。

至于國內(nèi)有公司宣稱的新產(chǎn)品Goldview，我們不想多加評論。因?yàn)閺臉O為相似的對比試驗(yàn)結(jié)果來看，該產(chǎn)品似乎就是AO（丫啶橙 ，一種judu產(chǎn)品，且熒光亮度不佳）。

GelRed核酸染料特性:

高靈敏度
GelRed 和 GelGreen 是目前市場中zui靈敏的凝膠核酸染料
穩(wěn)定性*
可以使用微波爐加熱，可以在室溫下保存
更安全
艾姆斯氏試驗(yàn)結(jié)果表明，該染料的誘變性遠(yuǎn)小于 溴化乙錠 （ EB ）
廣泛的適應(yīng)性
適用于預(yù)制凝膠和凝膠電泳后染色
染色過程簡單
與 EB 一樣，在預(yù)制膠和電泳過程中不必?fù)?dān)心染料降解；而電泳后染色過程也只需 30 分鐘且無需脫色或沖洗
對 DNA 和 RNA 的遷移影響極小
對核酸遷移的影響小于 SYBR Green I
與標(biāo)準(zhǔn)凝膠成像系統(tǒng)以及可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置*兼容
使用 312nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)時(shí)， GelRed 可以*的替代 EB ；使用 254nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)或可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置時(shí)， GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料

Biotium公司的GelRed 和 GelGreen 無論用于預(yù)制凝膠染色還是凝膠電泳后染色，都表現(xiàn)出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統(tǒng)而設(shè)計(jì)的 GelRed ，在使用了我們新開發(fā)的具有專li的試驗(yàn)步驟后（該試驗(yàn)步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統(tǒng)的 TBE 緩沖溶液），在凝膠電泳后染色中優(yōu)于或者至少相當(dāng)于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同， GelRed 在預(yù)制凝膠中使用時(shí)仍然有*的靈敏度，事實(shí)上GelRed 在檢測低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現(xiàn)出更高的靈敏度，尤其對小分子量的 DNA 檢測非常靈敏 GelGreen 可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見光激發(fā)的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無論是在預(yù)制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當(dāng)，但不存在后者的不穩(wěn)定性問題。實(shí)際上， GelRed 和 GelGreen ，特別是 GelRed 非常穩(wěn)定，可以長期在室溫下保存。當(dāng)這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時(shí)甚至可以使用微波爐加熱，便于采用常規(guī)方法制備預(yù)制凝膠。含有染料的預(yù)制凝膠可以成批制備，長期保存。

同樣重要的是， GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。獨(dú)立的測試服務(wù)公司（ Litron Laboratories, Inc. ）進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)艾姆斯氏測試結(jié)果表明， 在 18.5 μ g /mL （該濃度遠(yuǎn)高于推薦用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液）濃度下， GelGreen 沒有誘變性，而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時(shí)有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學(xué)結(jié)構(gòu)使其難以穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞，正是這一特性降低了染料的細(xì)胞毒性。如圖3。相反， SYBR Green I 廣泛地用于活細(xì)胞線粒體和核 DNA 染色，這正是由于它能快速的被細(xì)胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對紫外線導(dǎo)致的突變有強(qiáng)烈的增強(qiáng)作用（ Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91（2001） ），因此它的高細(xì)胞膜透性使它在紫外環(huán)境觀察時(shí)成為凝膠染色的主要有害物質(zhì)。