PicaGreen(效果同PicoGreen)dsDNA 定量檢測試劑盒 *2000次*
試劑組成:
產(chǎn)品名稱:PicaGreen(效果同PicoGreen)dsDNA 定量檢測試劑盒 *2000次*
種類:試劑盒
供應(yīng)商:北京索萊寶
試劑 | 體積 | 組 分 | 保存條件 | 保存期 |
Component A: PicoGreen 試劑 |
1ml 200× in DMSO |
Solution in DMSO | 4 ºC 避光 |
半年 |
Component B: TE
|
50mL |
|
室溫保存 | |
Component c:1ml 小牛胸腺DNA |
1 mL |
1ug/ml in TE Buffer |
4 ºC 保存 |
PicaGreen(效果同PicoGreen)dsDNA 定量檢測試劑盒 *2000次*
操作步驟:
1、試劑制備
PicaGreen dsDNA (Component A )(定量試劑是以1mL 的濃縮液形式保存在無水的DMSO(二甲基亞砜)中。實驗當(dāng)天,配制2XPicoGreen 試劑的操作溶液,用1xTE(Component B)按1:200 的比例稀釋濃縮液。如果要準備足夠的操作溶液測定20 個樣品,可在20mL1x TE (Component B)中加入100μLPicaGreen dsDNA(Component A ) 定量試劑。由于試劑容易吸附到玻璃表面,要在塑料容器中配制。PicaGreen 試劑(Component A )見光易降解,所以應(yīng)將配好的溶液用錫箔包住或放置暗處避光保存。溶液在配制好數(shù)小時內(nèi)使用,以保證*結(jié)果。
2、 DNA 標準曲線
2.1 預(yù)備1μg/mLdsDNA( Component c) 或貯存液于1x TE 中。根據(jù)在1cm 光程長度的比色杯中A260nm 時的吸光度確定DNA 濃度;相應(yīng)于1μg/mLdsDNA 溶液A260=0.02。盡管任何純化的dsDNA 制劑都可用來做標準曲線,但常用的是小牛胸腺DNA。用跟被檢測的樣品相似的DNA 做標準曲線,用或長或短的線型DNA的 片段測定相近大小的酶切片段;質(zhì)粒用于測定質(zhì)粒DNA。然而大部分線狀dsDNA 分子,不管其片段長度大小,都會產(chǎn)生大致相等的信號。PicaGreen 試劑測定法在通常污染核酸制劑的幾種復(fù)合物存在的條件下仍能保持線狀,盡管信號強度可能受到影響。因此,為了得到有效的對照處理,被用
來做標準曲線的dsDNA 溶液要用和實驗樣品相同的方式來處理,并且應(yīng)該包含相同的可能存在的污染物。
2.2 要產(chǎn)生從0.5ng/mL 到500ng/mL(見表1)單重復(fù)8 個點的標準曲線,在2X 終濃度下配制一系列的DNA 溶液,混合相同體積的2XDNA 和2XPicaGreen 操作溶液,放入10×10mm 比色杯中。混合相同體積的1XTE 和2XPicaGreen 操作溶液以備空白對照。避光于室溫下放置2-5 分鐘。
2XDNA 溶液濃度 (ng/mL) | 2XDNA 溶液的體積 (mL) | 2XPicaGreen 溶液的 體積(mL) | PicaGreen 試劑測定中DNA 的終濃度(ng/mL) |
1000 | 1 | 1 | 500 |
200 | 1 | 1 | 100 |
50 | 1 | 1 | 25 |
20 | 1 | 1 | 10 |
5 | 1 | 1 | 2.5 |
2 | 1 | 1 | 1 |
1 | 1 | 1 | 0.5 |
0 | 1 | 1 | 空白 |
表1 用10×10mm 比色杯時DNA 標準曲線
2.3 當(dāng)用微量檢測皿適配器時,PicaGreen 測定也可在較低的測定體積(50μL 到200μL)內(nèi)完成。欲產(chǎn)生從1ng/mL 到100ng/mL(見表2)的標準曲線,在2X 終濃度下配制一系列的DNA 溶液,混合相同體積的2XDNA 和2XPicaGreen 操作溶液,將至少50μL 溶液轉(zhuǎn)移到微量檢測皿中。確信不要在樣品中引入氣泡,輕輕地彈微量檢測皿的外部經(jīng)??梢则?qū)散氣泡。避光于室溫下放置2-5 分鐘。
2X DNA 溶液濃度 (ng/mL) | 2X DNA 溶液的體積 (uL) | 2X PicaGreen 溶液的體積(uL) | PicaGreen 試劑測定中DNA 的終濃度(ng/mL) |
200 | 30 | 30 | 100 |
50 | 30 | 30 | 25 |
20 | 30 | 30 | 10 |
5 | 30 | 30 | 2.5 |
2 | 30 | 30 | 1 |
0 | 30 | 30 | 空白 |
表2 用微量檢測皿時DNA 標準曲線
2.4孵育后用合適的熒光計測量樣品熒光值。選擇藍色激發(fā)光,用熒光值zui大的樣品校正儀
器。
2.5 測量剩余樣品的熒光值。不同的微型熒光計將給出一個直接的濃度讀數(shù),數(shù)據(jù)可以用來產(chǎn)生DNA 濃度的標準曲線,下面以TBS-380 微型熒光計為例。
圖1 PicaGreen 標準曲線
3、樣品分析
3.1 用1X TE 稀釋未知DNA 樣品至需要的體積(10×10mm 比色杯需1.0mL,微量檢測皿需25-100μL)。對樣品高度稀釋可以確保任何污染物都被zui大限度地沖淡。然而,也要避免取樣體積太小而無法精確吸取的情況。去除樣品中RNA 和ssDNA 參照4 部分。
3.2 在每個樣品中加入2XPicaGreen 試劑的操作溶液(3.1 節(jié)準備),混合好,將混合物移入合適的比色杯,避光于室溫下放置2-5 分鐘。
3.3 可以對樣品進行不同的稀釋處理重復(fù)測定以確保結(jié)果的準確性。
4 去除樣品中單鏈核苷酸
當(dāng)ssDNA 與dsDNA 等摩爾濃度時,后者的測定受前者的干擾很小。前者濃度10 倍于后者時,。對熒光信號的干擾也不過10%。但當(dāng)DNA 濃度低時,ssDNA 能產(chǎn)生較大干擾在高濃度時,由RNA 結(jié)合PicaGreen 試劑產(chǎn)生的熒光值用RNA酶處理樣品可消除。RNA 酶A、酶T1 結(jié)合核酸酶S1 能除去所有單鏈核酸,從而保證樣品熒光值是由dsDNA 產(chǎn)生。(具體做法請查閱相關(guān)的參考文獻)
參考文獻:
[1] Nucleic Acids Res. 24, 2623 (1996)
[2] BioTechniques 21, 372 (1996)
[3] BioTechniques 21, 664 (1996)
[4] Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 6091 (1996)
[5] Anal. Biochem. 102, 344 (1980)
[6] Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, J. Sambrook, E.F. Fritsch and
T. Maniatis, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York (1989)